【コア】

ジョーカー3

ジョーカー3の【ラストダンジョン】。高台に登って空を見上げ、【リアクター】を使えば存在を確認できる。
この【ブレイクワールド】を創り出した巨大な機械で、「マザー」とも呼ばれる。
マザーが作り出された経緯等はブレイクワールドのページを参照。
【マデュライト】のエネルギーにより動いているが、そのマデュライトにある男の悪意が宿っていたためにブレイクモンスターを生み出し続けるようになってしまった。
マザーから生まれた存在である【レナーテ】のみがマ素の汚染を浄化することができる。
マザー自体はブレイクモンスター扱いではないが、汚染について【ルキヤ】はマザーがブレイク化したと説明しているので、いつか【ヘルクラウド】等の様にモンスター扱いを受けるかもしれない。
　
内部はそれほど広くないものの、空中ライドや水中ライドなど様々な手段を駆使して進むことになる。
出現モンスターは【凶スライム】、【凶にじくじゃく】などブレイクモンスターばかり。強い割に経験値があまり多くなくスカウト不可のため奥に向かうだけなら戦闘は避けた方がいい。
【ぬしさま】と【レオン・ビュブロ】はブレイクモンスターでないが、クリア後はそれらもブレイクモンスターに置き換わる。
とはいえ、2匹はその後のワールドマップや【凍骨の氷原】（ぬしさまのみ）でも出現するので、わざわざここでスカウトする必要はない。
なお、ラスボス戦後、スターシードが完成するまでの間は突入口から先に進むことができない。
ルーラで奥地まで飛ぼうとしても効果がかき消されてしまう。
前述の通りここに出るブレイク系モンスターはスカウトできないためダグジャガルマを倒した後は【星のまもり】ぬすっと斬りでマデュライト狩りをするためだけの場となるだろう。

第一層

あちこちにセンサートラップが張り巡らされており、
触れると姿を消していた凶モンスターたちが襲い掛かってくる。凶モンスターが潜伏している所をリアクターでサーチすると表示されるようになるが、センサーに触れるまでは半透明になっておりライド攻撃も効かない状態になっている(触れると戦闘になるので注意)。
張り巡らされたレーザーには一部フェイクが混じっており、リアクターを使うことで判別できる。
また、水中では【凶トドマン】が眠っているほか、【ぬしさま】が悠々と泳いでいる。こいつはブレイクモンスターではないので、スカウト可能。
ただし、このぬしさまはクリア後は【凶ぬしさま】になりスカウトできなくなる。
第二層へ続く階段の手前では【凶クラーゴン】【凶ぐんたいガニ】【凶スカルゴン】と戦闘に。
【てんぺんちい】や【マヒャデドス】等で大ダメージを与えてくる。

第二層

高濃度のマ素でできた障壁に阻まれて先へ進めないため、マデュライトの結晶を3つ壊す必要がある。
壊すべき結晶はリアクターを使えば分かるが、一部分かりにくい場所にある。
凶キメラ達が頻繁にこちらを見つけて追ってくるのが嫌らしい。
奥に進むにつれて所々に赤や紫色の肉塊のような物体が散見されるようになり、最深部手前には臓器のような不定形(【マンモデウスの中】に似ている)が入り口を覆うなど、第一層の機械的な雰囲気から打って変わってグロダンジョンの様相を醸し出す。
　
ここでも中ボス戦が三回ある。
一回目は【ギャスモン】【凶キメラ】【凶キングリザード】。
二回目は凶キングリザードの代わりに【凶フォレストドラゴ】になっている。
また、最深部手前では【凶アークデーモン】と凶にじくじゃく、凶キメラが道を塞いでいる。

上の方の通気口のような場所にいる【レオン・ビュブロ】は凶モンスターではないのでスカウト可能。
ただし、クリア後は【凶レオン・ビュブロ】に置き換わる。

第三層

マザーの心臓部のある場所。
ここで【ダークマスター】率いる【カシャロット】【アパデマク】との戦いになる。
その後全ての元凶である【ガルビルス】との戦いが待っているが、連戦ではない。
　
この最深部にはスリープカプセルがたくさんあり、故郷の星から運ばれてきた人間たちが眠っている。
本来はマザーがブレイクワールドを創り上げたあと目覚めるはずだったが、ガルビルスに乗っ取られてしまったためずっと眠り続けたままだった。
　
更に裏シナリオでも【ダースガルマ】と【ダグジャガルマ】の連戦がここで待つ。

ジョーカー3プロ

オリジナル版では野生個体の出番が皆無だった【凶なげきムーン】が配置された。代わりに凶キメラの数が減らされているが、いない訳ではない。
他には凶スライムの何体かが【凶とげジョボー】に置き換わったりしている等細かな違いはあるが、大きな変化はこれと言って無い。こちらもいない訳ではない。
無印版だと水中で眠っていた凶トドマンだが、本作では起きているのでこいつの前を横切ったら追いかけてきてびっくりした人も多いのではないだろうか。
ちなみにこの凶なげきムーンは【ギガボディ】を持つ通常のなげきムーンに比べてとても小さい。
同じギガボディのレオン・ビュブロやぬしさまを配置する空間があるのにギガサイズの凶なげきムーンは一匹も配置できなかったのか……。
ボスが多いうえにイベントが長くスカウト不可、中のアイテムも大したものがないためオリジナルをプレイ済みの人はスキップするのもアリ。