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ミッション概要 
ドゥームアイでの任務にして最終決戦。敵の猛攻が激しく、実質的なラスボスも一筋縄では行かない強敵。
ボーナス
| ボーナス内容 | 加算ボーナス点 | |
| ノーマルモード | ハードモード | |
| ローンウルフチップ不使用ボーナス | 12000点 | |
| クリアタイムボーナス(15:00) | 12000点 | |
| サムスのボムからダメージを受けない | 10000点 | |
メダルノルマ
| メダル数 | メダル入手スコア | |
| ノーマルモード | ハードモード | |
| 1枚 | 0点 | |
| 2枚 | 24000点 | 28000点 |
| 3枚 | 36000点 | 40000点 |
攻略のコツ
持参する装備はフリーズショットたくさん、ボム1つはあると良い。ハードだとシールドやデコイが必須レベル。
最初のパイレーツ戦がかなりの総力戦で、遠くから狙撃するパイレーツ、突撃するトゥルーパー、やたらと固いエリートパイレーツとエリートトゥルーパー、攻撃が当てづらくミサイル攻撃が強力なフライングパイレーツ（エリート含む）と大量に出る。また隠れる壁が殆ど無いために、攻撃の的になりやすい。そこでここでシールドやデコイを使って耐え凌ぐ必要がある。
そのまま補給用の箱無しで、2回目のパイレーツ戦。だがここには壁があるので、この壁を利用して戦えば、割と楽に突破できる。途中で出るエリートブリーザーは相手にすると非常に厄介極まりないので、ボムで仕留めよう。
アイテム補給をした後、パイレーツに捕まってしまったサムスが巨大化して襲ってくる実質ラスボス戦。モーフボールの横の穴が弱点で、そこに攻撃すればモーフボールが停止するので、そこにショットを撃って、電撃の壁に当てて、ダメージを与える。4回x3フェイズでフェイズが進むにつれて小さくなると同時に動きも速くなり、こちらの攻撃が当てにくくなる。突進はサイドステップで回避。フェイズが進むにつれて回数も多くなるので極力回避に専念すること。ボムは青と赤の2種類有り、青は遠くにいれば当たらないが、赤は爆発範囲がほぼ全域なので破壊する事。破壊すると、まれにミサイルなどの武器が出現する場合がある。第2段階からはスパイダーボールで天井をウロウロし始める。最後に中央から落下してくるので、そこが攻撃の狙い目。地面に落下した際に衝撃波が発生するのでジャンプによる回避も忘れずに。
サムスを元に戻したら、マスターブレインを破壊し、時間内に3度目のパイレーツ戦を終わらせて脱出する。
ノーマルモードでもなかなかメダル3枚評価は難しいが、ハードモードだとローンウルフ未使用＋タイムボーナス＋ボーナスミッションがほぼ必須と思われる。特に最初のパイレーツ戦が厳しいので、シールドやデコイで徹底的に乗り切ろう。サムス戦は、第1段階は普通に倒し、第2段階からフリーズショットを弱点に向けて当てる→弱点にまた当てる→止まったところを攻撃、という流れで手早く倒そう。フリーズ時間延長のチップがあるといいかもしれない。
ほかにも、ミサイルなどの爆風による攻撃範囲の広い武器であれば直接弱点に当てなくても
範囲攻撃でダメージを与えられるので、それを活用するとあっさりと倒せてしまう場合も。
チップ
①スタートしてゲートと反対側にログと一緒にある。
②サムス戦前の部屋の通風孔の扉を破った先。
③サムス戦後のジャンプして渡る通路の足場の下側。
④サムス戦後のジャンプして渡る通路の上側の足場。柱付近に赤いジャンプポイントがあるので、それに乗ると上側に行ける。なぜか前の部屋の前まで道が通じている。
どうしてもクリアできない人へ
サムスを攻略すれば、ほぼクリアしたようなものです。まぁあいかわらず、強いですが。
下画面で自分がどこにいるか確認しつつ逃げないとサムスに当たりまくることになります。
サムス
| 傾向 | ① ゴロゴロ転がる。 ② ときどき青玉（小爆発する）、赤玉（大爆発する）を出してくる。 ③ 突進攻撃。 第2形態、第3形態では、天井を規則的に回りだし、頂点からドスンと 落ちて衝撃波攻撃。さらに突進攻撃が激しくなります。 |
| 対策 | ① まず、サムスに当たらないように下画面も活用して逃げます。 ② 青玉赤玉は積極的に破壊します。（ときどきアイテムが出るので） ③ 突進攻撃はサイドステップ２回で回避して、すぐ振り返り・・・・繰り返しです。 ④ ショックショット、フリーズショットが有効です。 ⑤ バリアが解けたら、ダメージ壁めがけてフルチャージビームでビームシュート!! |
| パイレーツ広場 | ① 正面突き当たりの左、２階部分が屋根になっているところの真下に陣取ります。 ② まずそばにいるパイレーツを単発ビーム連射。 ③ 遠くのパイレーツはロックオンして単発ビーム連射。 ④ フライングパイレーツはフリーエイムのフルチャージビームで攻撃。 （移動パターンがあります。） （さらに奥にずっといれば、ミサイル攻撃もしてきません。） ⑤ 遠くにいるエリート系はフリーエイムのフルチャージビームで攻撃。 （あまり動かないので当たりやすいです。） （柱に隠れる輩はロックオンで単発ビーム連射。） |
| グリムタレット通路 | ① 陣取る場所は入ってすぐ左のへこみ部分です。 ② グリムタレットをいくつか破壊するとパイレーツ第1陣。 ③ ①から動かずに来た敵をフリーエイムのフルチャージビーム。これだけで楽勝です。 ④ ③殲滅後、グリムタレットを残り２つにすると、パイレーツ第2陣。 ④ エリートブルーザーはセンサーボムで瞬殺。（それ以外は③と同じ） |
| サムス第1形態 | ① 避けるのが一番やっかいなので、センサーボム攻撃。 なければ、絶好のポジションでショックショットなどで動きを止めて攻撃。 ② 多少のダメージは覚悟して短期戦で!! ③ バリアが解けたら、2～3回を目標に壁にぶつけます。 |
| サムス第2形態 | ① 地上にいるときは避けるのに専念します。 ② 天井に行きだしたら狙いつつ、落ちてきたとき弱点部分が真正面にくるように 位置取りをします。 ③ 落ちてきたところを集中砲火。 (衝撃波はよけて下さいね。) ④ この繰り返しです。 |
| サムス第3形態 | ① 第2形態との違いは、気のせいか、ドローンの攻撃がよく当たるようになります。 ② なので、対処としては第2形態とほぼ同じです。 |
| ジェネレーター | ① アイテムボックスの部屋でサブウェポンフル装備。 ② グリムタレットを完全無視でドゥームアイにフルチャージビーム。 ③ ザコ敵をロックオンしてサブウェポンもフル活用で素早くもれなく全滅させます。 |
推奨サブウェポン
| リペアカプセル | 6 | リペアカプセル | 6 | |
| センサーボム | 1 | センサーボム | 1 | |
| ショックショット | 1 | フリーズショット | 1 |
推奨チップ
| ローンウルフ | ローンウルフ | |
| エンハンスヒール | ダメージガード | |
| スーパーチャージャー | スーパーチャージャー |
