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添付- Opening
- Chapter-1 あらしのうみで
- Chapter-2 ギルドにゅうもん
- Chapter-3 じくうのさけび
- Chapter-4 みはりばん
- Chapter-5 はじめてのたんけん
- Chapter-6 ドクローズ
- Chapter-7 ギルドえんせいへ
- Chapter-8 グラードンのしんぞう
- Chapter-9 きりのみずうみのなぞ
- Chapter-10 ヨノワール
- Chapter-11 とうぞくジュプトル
- Chapter-12 のこされたかのうせい
- Chapter-13 ヨノワールのひみつ
- Chapter-14 みらいせかいへ
- Chapter-15 ほしのていしのしんじつ
- Chapter-16 よあけのおもい
- Chapter-17 ギルドのなかまたち
- Chapter-18 ラプラス
- Chapter-19 まぼろしのだいちへ
- Chapter-Final さいごのぼうけん
Opening 
- 質問に答えると、自動的に主人公ポケモンが決まる
- パートナーを選び、Chapter-1へ
Chapter-1 あらしのうみで
- 浜辺で主人公が倒れているところをパートナーに見つけてもらい、主人公の名前を決める
- ズバット、ドガースたちにパートナーの持っていたいせきのかけらを奪われる
- かいがんのどうくつへ
- もくてき：うばわれたものを とりかえす
- B4Fの次のかいがんのおくそこまで進み、ズバット、ドガースを倒す
- ボスがいるフロアに入ると、ポケモンのHPとPPが全回復する
- ボスがいるフロアでは、ふしぎだまのこうかがない
- いせきのかけらを取り返し、たんけんたいに入ることを決める
- ここまでのぼうけんをきろくする
- Chapter-2へ
Chapter-2 ギルドにゅうもん
- プクリンのギルドに行き、たんけんたいのチーム名を決める
- ポケモンたんけんたいキットを開け、たんけんたいバッジ、ふしぎなちず、トレジャーバッグをもらう
- トレジャーバッグの中には、道具が２つ入っている 何が入っているかは主人公と波動で異なる 詳細はページトレジャーバッグ参照
- ここまでのぼうけんをきろくする
- これからは、じぶんのベッドでもぼうけんをきろくできるようになる
- ドゴームに起こされ、あさのあいさつをした後、ペラップに付いていきバネブーからの依頼を受ける
- しめったいわばへ
- もくてき：バネブーのしんじゅを さがす
- トレジャーバッグのおかげで、16個までの道具を取っておけるようになっている
- ぼうぎょスカーフ、ブルーリボンをポケモンに持たせよう
- B7Fまで進み、バネブーのしんじゅを手に入れる
- ギルドに戻り、バネブーにしんじゅを渡すと、お礼にタウリン、リゾチウム、ブロムヘキシン、2000Pをもらえる
- ばんごはんをガツガツムシャムシャ食べる
- Chapter-3へ
Chapter-3 じくうのさけび
- ドゴームに起こされる
- ここまでのぼうけんをきろくする
- ペラップに連れて行かれ、右の掲示板の依頼を受けることになる
- ビッパに付いていき、トレジャータウンの紹介などをしてもらう
- カクレオンの店に行き、なぞの声を聞く
- スリープのところへ行き、予知夢を見る
- ビッパが待つギルドへ行き、スリープの依頼を見る
- トゲトゲやまへ
- もくてき：ルリリをたすける
- 10Fまで進み、スリープを倒す
- トレジャーバッグが大きくなり、24個までの道具を取っておけるようになる
- お礼に300ポケもらえる
- 依頼を3つ以上解決する
- Chapter-4へ
Chapter-4 みはりばん
- ディグダの代わりにみはりばんをする
- 成績がよいとペラップからごほうびをもらえる
- 依頼を2つ以上解決する
- Chapter-5へ
Chapter-5 はじめてのたんけん
Chapter-6 ドクローズ
- 依頼を解決する
- みはりばんの仕事をする
- どこでもよいのでダンジョンを探検する
- ペラップからセカイイチをもってきて欲しいと頼まれる
- エレキブル連結店がオープンし、わざのれんけつができるようになる
- リンゴのもりへ
- 12Fまで進み、セカイイチを手に入れる
- ビッパたちに食べ物をもらう
- グレッグルのトレード店がオープンし、トレードできるようになる
- 依頼を解決する
- みはりばんの仕事をする
- 依頼を解決する
- トレジャーバッグが大きくなり、32個までの道具を取っておけるようになる
- ペラップに話しかけ、遠征に出発する
- Chapter-7へ
Chapter-7 ギルドえんせいへ
- えんがんのいわば入り口に辿り着く
- 何度でも挑戦できるちいさなよこあなを冒険する
- えんがんのいわばをB9Fまで進む
- ツノ山入り口に辿り着く
- 何度でも挑戦できるいわのよこあなを冒険する
- ツノ山を14Fまで進む
- Chapter-8へ
Chapter-8 グラードンのしんぞう
Chapter-9 きりのみずうみのなぞ
- ねっすいのどうくつ入り口に辿り着く
- ねっすいのどうくつを8Fまで進む
- ねっすいのどうくつ さいじょうぶに辿り着く
- ねっすいのどうくつ さいじょうぶを8Fまで進み、グラードンを倒す
- トレジャーバッグが大きくなり、40個までの道具を取っておけるようになる
- Chapter-10へ
Chapter-10 ヨノワール
- ギルドでヨノワールの話を聞く
- 依頼を受けると、しずかなかわに行けるようになる
- 依頼を受けると、コロコロどうくつに行けるようになる
- 依頼を受けると、みどりのそうげんに行けるようになる
- 依頼を受けると、ちいさなはらっぱに行けるようになる
- 依頼を受けると、オレンのもりに行けるようになる
- ペラップからセカイイチの状況を調べるように言われる
- カクレオンのお店にいく
- ペラップに報告する
- ダンジョンを探検する
- マリルとルリリの頼みを受ける
- エレキへいげんへ行き、10Fまで進む
- エレキへいげん中継地点にたどり着く
- エレキへいげん おくちへ
- 10Fまで進み、レントラーとルクシオを倒す
- マリルとルリリにみずのフロートを渡す
- ヨノワールに話しかける
- Chapter-11へ
Chapter-11 とうぞくジュプトル
- ペラップの話を聞く
- ギルドに行きミーティングに参加する
- きたのさばくへ行き、15Fまで進む
- ギルドで報告し、パートナーと相談する
- りゅうさのどうくつへ行き、B10Fまで進む
- りゅうさのどうくつ中継地点にたどり着く
- りゅうさのどうくつ さいしんぶへ
- B11Fまで進み、エムリットを倒す
- Chapter-12へ
Chapter-12 のこされたかのうせい
- ギルドの朝礼に出る
- すいしょうのどうくつへ
- B11Fまで進む
- すいしょうのどうくつ奥底に辿り着く
- だいすいしょうのみちの入り口を開く
- 水晶は赤→緑→紫→オレンジ→黄→青の順番で変わるので、全てを青に変える
- だいすいしょうのみちへ
- B14Fまで進み、ジュプトルを倒す
- ジュプトルに負けても、やり直しにはならない
- Chapter-13へ
Chapter-13 ヨノワールのひみつ
Chapter-14 みらいせかいへ
- 部屋の扉を調べる
- ジュプトルに質問を出されるので答える
- くうかんのどうくつ入り口に辿り着く
- くうかんのどうくつB8Fまで進む
- くらやみのおか入り口に辿り着く
- くらやみのおか15Fまで進む
- ふういんのいわば入り口に辿り着く
- ふういんのいわばB8Fまで進む
- ふういんのいわば中継地点にたどり着く
- ふういんのいわば おくちに進む
- B7Fまで進み、ミカルゲを倒す
- Chapter-15へ
Chapter-15 ほしのていしのしんじつ
Chapter-16 よあけのおもい
Chapter-17 ギルドのなかまたち
- ギルドで話す
- 再び施設が使えるようになるので、買い物などをする
- 掲示板の依頼を受ける
- たきつぼのどうくつへ
- 温泉でコータスと話す
- ギルドの朝礼に参加する
- サメハダ岩へ行く
- 海岸へ行く
- Chapter-18へ
Chapter-18 ラプラス
- ギルドの朝礼に参加する
- いそのどうくつ入り口に辿り着く
- ペラップが付いてくる
- いそのどうくつB9Fまで進む
- いそのどうくつ中継地点にたどり着く
- いそのどうくつ さいしんぶへ
- B6Fまで進み、カブトプスとオムスターを倒す
- Chapter-19へ
Chapter-19 まぼろしのだいちへ
- まぼろしのだいち入り口に辿り着く
- ジュプトルが再び付いてくる
- 15Fまで進む
- まぼろしのだいち中継地点にたどり着く
- まぼろしのだいち おくちへ
- 9Fまで進み、ヨノワールとヤミラミを倒す
- Chapter-Finalへ
Chapter-Final さいごのぼうけん
- じげんのとう入り口に辿り着く
- 13Fまで進む
- じげんのとう中継地点にたどり着く
- じげんのとう さいじょうぶへ
- 11Fまで進み、闇のディアルガを倒す
- エンディングへ
