ストーリー

オープニング

ケロロ軍曹が偶然手に入れた古いゲーム機。
起動させると、なぜかゲームの中のモンスターが現実世界に出現してしまう。
モンスターをなんとかしようとしたケロロたちは、逆にゲームのような世界へ送り込まれてしまった！
そこは現実世界そっくりさんたちが存在する、3つの文明が交差する世界。
ドット絵になってしまったケロロ小隊は世界を救い、元の世界に帰れるのか！？　

世界観

武者ケロとなって挑む世界

峠の関所で人々の通行を取り締まり、他の地方との交流を断つことで独自の文化を花開かせた地域。
最近まで各地で続いていた戦乱の傷跡が残る場所もあるが、
ここに暮らす人々の多くは、慎ましく真面目に生きている。

ここでケロロたちは雪深い隠れ里に辿り着く。

山神に花嫁を差し出すかわりに、外敵から村を守る加護を得てきた。
隠れ里で、一行は山神への嫁入りを明日に控えた少女と出会う。
一度山神の花嫁となれば二度と里には戻れない。
そんな過酷な運命にも、文句ひとつ言わずに従う少女ーはたして少女の真意とは？

海賊ケロとなって挑む世界

大海原の真ん中に突如出現する巨大な滝。
流れ落ちる滝のカーテンによって外界と隔てられたこの地域の大部分は海で、
所々に浮かぶ島々の間を航行する船乗りたちが、顔を利かせるワイルドな地域だ。
海の真ん中の滝にうっかり突っ込み、真っ逆さまにこの地域に落ちてきたケロロたちは
気風のいい海賊の船長、キャプテン・フロッグに救われる。

キャプテンの船で旅を続ける一行だったが、
人を惑わし船を沈めるセイレーンの歌声に捕らえられ、再び絶体絶命のピンチに！
不思議と危険だらけの海の世界で、ケロロ小隊を待ち受ける冒険とは？

騎士ケロとなって挑む世界

険しい山々や広大な砂漠、そして神秘的な深い森。
手つかずの自然の中に築き上げられた質実剛健な石の
文明は、秩序を重んじる騎士たちの気質にふさわしい。

この地域最大の王都で、一行は王女の行方不明事件に
首を突っ込むことに。

太陽のように明るい王女を失った都で、
その救出のために立ち上がるひとりの少年騎士と出会ったケロロ
小隊は、その勇気を発揮することができるのか？