- 女性主人公シナリオを追加
- 一部ペルソナのグラフィック変更
- 追加衣装あり(ゆかりのミニスカサンタ、女主人公の私服)
- 戦闘難易度は5段階(最低難度ビギナー~最高難度マニアクス)
※マニアクスは周回特典引き継ぎ不可 - 仲間に直接指示可能
- マップ移動が簡略化。画面をポインタが移動する形式に
- 戦闘コマンドに「ガード」追加(待機と入れ替え)
- コミュアルカナ数は22(Fesと同じ)
- 初召喚はムービーではなく戦闘画面内で
- P4からの新ペルソナ追加(少なくともセタンタ-ネコショウグンは確定)
- P4のかばう-食いしばりシステム追加
- アナライズはP3準拠
- 絆を深めれば合体攻撃もあり
- ある程度以上ペルソナを育てればスキルカードが手に入る
- ミックスレイドはアイテム扱いに(詳細不明)
- 黒沢巡査から失踪者クエストあり
- 音源に一部変化あり