パワポケダッシュ、パワポケRに登場したNPB12球団の代わりに用意されたプロ12球団でそれぞれベース元の球団のイメージに近いオリジナルチームとなっている。
- パワフル・リーグ
パシフィック・リーグがベースで略称パワリーグ。二軍はノーザン・リーグ。球団名 ベース元の球団 ファルコンズ 福岡ソフトバンクホークス スワンズ*1 千葉ロッテマリーンズ キングス 埼玉西武ライオンズ フェニックス 東北楽天ゴールデンイーグルス ソルジャーズ 北海道日本ハムファイターズ ファルコンズ オリックス・バファローズ
- ポケット・リーグ
セントラル・リーグがベースで略称ポケリーグ。二軍はサザン・リーグ。球団名 ベース元の球団 ガリバーズ 読売ジャイアンツ ジャガーズ 阪神タイガース ワイバーンズ 中日ドラゴンズ シーサイズ 横浜DeNAベイスターズ フィッシャーズ 広島東洋カープ シーガルズ*2 東京ヤクルトスワローズ
パワポケダッシュ
育成選手設定時の志望球団選択で登場。以降の作品にパスワードで選手登録する際ベース球団に変更される。
パワポケR
モグラーズ編の対戦球団で登場。選手は発売時にベース元の球団に支配下所属していた選手の能力そのままに顔、名前は架空のものとなっており各モードで使用可能。