「クリア特典」
本編エンディング後にセーブされたデータを使って始めると、エンディング後の世界を冒険することができる。
以下のような変化がある。
「隠しダンジョン」
・隠しダンジョンがいくつか追加される。
１チョコボの思い出
２クロマの未来
３ヒーローからの挑戦状１
４ヒーローからの挑戦状２（条件あり）
５ヒーローからの挑戦状３（条件あり）
「時刻みの街」
「時忘れの街」の名称が「時刻みの街」に変化する。
「商品追加」
各ショップに並ぶ商品が一部追加される。詳しくはショップの項目をご覧下さい。