ニコニコ鉄道学園プロジェクト/穂木海洋キャンパス

【水産学部】
穂木海洋キャンパスの海側にある方の学部。養殖から食品開発までが学べる学部で、このキャンパスの6割がこの水産学部に所属している。地域の漁協と連携協定を結んでおり、水産品に関しては宮潟市にある穂木南部魚類市場でセリにかけられる。
【海洋科学部】
海洋キャンパスの山側の方にある学部。海洋土木を主に学べるキャンパスであり、ニコ鉄世界で進む海洋開発の新たなる人材育成の一翼を担う学部。