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添付（サントラ未収録を除き）全92曲。番号は「『WILD ARMS Alter code:F』ORIGINAL SCORE」におけるディスク・トラックナンバー。
各ディスクにはロディ、セシリア、ザック、ハンペンの一枚絵が描かれている。
全曲の作曲をなるけみちこが担当している。
Disc 1 
| No. | タイトル | 備考 |
|---|---|---|
| 1-1 | Alter code：F? | タイトル画面 |
| 1-2 | イントロダクション? | ニューゲーム開始時シーン |
| 1-3 | 希望の少年? | ロディ編オープニング開始シーンなど |
| 1-4 | 素朴な暮らし | サーフ村、ヤード、コートセイム |
| 1-5 | ファルガイア? | アウトフィールド |
| 1-6 | 暗闇を征く? | ベリーケイブ、マウンテンパスなど |
| 1-7 | 戦う力 | メイン三人が揃っていない時の通常戦闘 |
| 1-8 | 驚愕? | リリティア発見シーンなど |
| 1-9 | 錯綜? | ロッティングビースト戦（1回目）終了後シーンなど |
| 1-10 | ほんの腕試し? | ザック編オープニング開始シーン、パズルボックスロビー |
| 1-11 | 力を求めて? | ザック紹介シーン |
| 1-12 | 遺跡に臨む? | リリティアの棺、ケイジングタワーなど |
| 1-13 | 暴走? | |
| 1-14 | 立ちはだかる影? | 多くのボス戦 |
| 1-15 | 勝利? | 戦闘リザルト |
| 1-16 | 展開? | セシリア編オープニング開始シーンなど |
| 1-17 | クラン修道院? | クラン修道院 |
| 1-18 | 迷いの路? | 封印図書館、アーデルハイド地下道など |
| 1-19 | 奸計? | |
| 1-20 | 接触? | 守護獣との契約シーン |
| 1-21 | 世界にひとりぼっち? | 忘れられた廃屋など |
| 1-22 | 荒野の果てへ | オープニングデモ |
Disc 2
| No. | タイトル | 備考 |
|---|---|---|
| 2-1 | アーデルハイド城? | アーデルハイド城 |
| 2-2 | 束ねる力 | 通常戦闘 |
| 2-3 | 窮地? | |
| 2-4 | アーデルハイド城下町? | アーデルハイド城下町（初期＆完全復興後） |
| 2-5 | モーニングコール? | 宿屋宿泊時 |
| 2-6 | 古代文明博覧会? | 古代文明博覧会 |
| 2-7 | 悲鳴をあげる世界? | アーデルハイド襲撃シーンなど |
| 2-8 | 不安から焦燥へ? | |
| 2-9 | バーサーカー? | ベルセルク戦 |
| 2-10 | 決意、そして? | ユリウス崩御シーンなど |
| 2-11 | 葬列? | 国葬イベント～タイトルコール（歌：麻生かほ里） |
| 2-12 | 姫巫女? | |
| 2-13 | 町並み? | ミラーマ、ティムニーなど |
| 2-14 | 日常? | 主にコミカルなシーン |
| 2-15 | 世界を支える力? | 守護獣神殿、無限連環永久機関、深淵の龍宮 |
| 2-16 | 後悔? | |
| 2-17 | 策略? | |
| 2-18 | 大登場? | ジェーン登場シーン |
| 2-19 | 滅びた町? | セントセントール（壊滅後～結界再生まで）、堕ちた聖域など |
| 2-20 | 無常? | エルゥのほこら |
| 2-21 | 勇気? | エルゥのほこら使用時 |
| 2-22 | スイートキャンディ号? | スイートキャンディ号、海上移動時 |
| 2-23 | 海上の偽装結婚式 | 偽装結婚式イベント |
| 2-24 | にくいあんちくしょう? | ゼット登場シーン＆戦闘 |
| 2-25 | パズル | パズルボックス |
| 2-26 | クリア | パズルボックスクリア |
Disc 3
| No. | タイトル | 備考 |
|---|---|---|
| 3-1 | 戦士の口笛? | ブーメラン登場シーン |
| 3-2 | 連帯感? | ファルガイア自警団関連シーン、サブキャラクター加入シーンなど |
| 3-3 | 狂える詩人? | アルハザード戦 |
| 3-4 | おっまかせ☆ | ジェーン操作時通常戦闘 |
| 3-5 | 疑問? | ハンペン推理シーン |
| 3-6 | フォトスフィア? | フォトスフィア |
| 3-7 | Gの咆哮? | 各ゴーレム戦 |
| 3-8 | 暗黒の聖母? | マザー登場シーン |
| 3-9 | 仲間たち? | アースガルズ、ガルウイング関連ムービー |
| 3-10 | 戦いと享楽と? | 魔王の練兵場 |
| 3-11 | ゲーム? | スパイダーウェブ（闘技場） |
| 3-12 | 脅威? | ゲートジェネレイター最奥部到着シーン |
| 3-13 | 暴走する破壊力? | ジークフリード戦（1回目）終了後シーンなど |
| 3-14 | 沈黙する君? | ゲームオーバー時、ロディ左腕欠損シーンなど |
| 3-15 | エルゥ界? | エルゥ界アウトフィールド |
| 3-16 | 閉ざされた村? | 秘密の花園、タージェン村など |
| 3-17 | 祖父? | ロディ昔語りシーン |
| 3-18 | 解放? | 貴種守護獣覚醒シーン |
| 3-19 | 発進? | プロトウイング飛行実験シーン |
| 3-20 | 神鳥の翼? | プロトウイング・ガルウイング移動時 |
| 3-21 | 竜巻? | ハンペン操作時 |
| 3-22 | 鋼鉄の四傑? | ヴォルカノントラップ、ゲートジェネレイターなど |
| 3-23 | ABYSS? | ABYSS |
| 3-24 | 奈落、垣間見て? | ラギュ・オ・ラギュラ戦 |
Disc 4
| No. | タイトル | 備考 |
|---|---|---|
| 4-1 | 慟哭と約束と? | 裏オープニング |
| 4-2 | 思慕? | エルミナ関連シーン |
| 4-3 | 斬り姫? | レディ・ハーケン戦 |
| 4-4 | 天を突く魔塔? | カ・ディンギル浮上シーン |
| 4-5 | カ・ディンギル? | カ・ディンギル |
| 4-6 | 戦鬼? | ブーメラン戦、ブーメランフラッシュ戦 |
| 4-7 | 寂寥? | ブーメラン戦終了後シーン |
| 4-8 | マルドゥーク? | マルドゥーク |
| 4-9 | 魔槍? | ジークフリード戦 |
| 4-10 | まだ終わらない? | ジークフリード戦終了時 |
| 4-11 | 急転? | ゲートジェネレイター暴走シーンなど |
| 4-12 | 万有必滅? | マザー戦、マザーフリード戦 |
| 4-13 | 回天? | マザーフリード戦終了後シーン |
| 4-14 | 星の海へ? | 亜空間エレベーター使用時 |
| 4-15 | Windward Birds? | ジーク・ツヴァイ戦（歌：麻生かほ里） |
| 4-16 | 灰燼に帰す? | カ・ディンギル崩壊シーン |
| 4-17 | おやすみ、アースガルズ? | アースガルズ停止シーン |
| 4-18 | ここからはじまるプロローグ? | エンディングシーン |
| 4-19 | 足跡? | エンドクレジット（歌：麻生かほ里） |
| 4-20 | 命集う世界? | トゥルーエンディングシーン |
サントラ未収録曲
- 「Windward Birds」インストバージョン3種：
- アースガルズ起動時／ロッティングビースト戦（2回目）
- マザーフリード戦終了後、マルドゥーク脱出時
- ジークツヴァイ戦（2ループ目以降）
