メインメニュー画面より「設定」を選択することで設定画面に移動できる。
ここには、設定画面にて設定できる各項目を説明する。
難易度（難易度設定）
ゲーム中の挙動、一部操作の自動化など、ゲームの難易度に関わる部分の設定。
難易度
以下の3種類から選択する。デフォルトはノーマル。なお、採点基準については全難易度で共通。
- イージー
停止位置はホーム内に編成が収まっていれば合格。不合格でもHP減少なし。 - ノーマル
基本の難易度。停止位置はホーム内に編成が収まっていれば合格。不合格の場合HPが減少する。 - ハード
ATSによるブレーキがパターン動作を除いて全て非常ブレーキになり、停止するまで緩解は不可能。停止位置はホーム内に編成が収まっていることに加え、停止目標から±3m以内であれば合格。
停止位置の修正
自動か手動かを選択。自動の場合、停止位置が不合格だった場合正しい停止位置までワープする。大幅なオーバーランで車掌が非常ブレーキを扱った場合は、この設定によらず自動修正となる。
駆け込み乗車
無、少、中、多の4つから駆け込み乗車発生の頻度を選択。主に車掌乗務時の難易度に影響する。駆け込み乗車が多いと、ドアを閉めるタイミングがつかみづらくなり、列車の遅延の原因になる。
空転・滑走
無、少、中、多の4つから空転や滑走のしやすさを選択。主に悪天候時の運転難易度に影響する。空転や滑走が発生すると、思うような加減速ができなくなったり、乗り心地が悪化したりする。
終点での折返し機器扱い
なしか自動か手動かを選択。手動の場合、終点到着後に自分の操作で乗務員室内の機器類を操作して折り返し準備を行うことになるが、採点は行われないので省略可。
開始タイミング
発車直前か100秒前か200秒前かを選択。発車時刻より指定した時間分前の時刻にゲームが開始する。発車前にブレーキ試験などをする時間をとりたい人向けの設定。ただし、乗務開始駅で元々の停車時間が設定した時間より少ない列車の場合は、設定によらず到着時刻からの開始になる。
鍵操作（車掌乗務）
なしかありかを選択。ありの場合、ドアスイッチに鍵が挿されていない状態ではドアを開けることができない。
停車ブザー応答
手動か自動かを選択。停車駅手前で車掌から送られてくる停車ブザーへの応答を自動で行うかを設定する。
入換、回送開始ブザー合図
手動か自動かを選択。入換や回送などの非営業列車で発車する前のブザー合図を自動で行うかを設定する。
ATSリセット
手動か自動かを選択。ATSの非常動作で停止した際に復帰操作を自動で行うかを設定する。手動の場合、復帰操作を手動で行わなければ再度発車することができない。
前照灯の操作
手動か自動かを選択。自動の場合、暗い場所など状況に応じてロービームとハイビームの切り替えが自動で行われる。
計器灯の操作
手動か自動かを選択。自動の場合、暗い場所など状況に応じて点灯状態の切り替えが自動で行われる。
ワイパーの操作
手動か自動かを選択。自動の場合、状況に応じてワイパーの動作状態の切り替えが自動で行われる。
EBリセット
手動か自動かを選択。EB装置のブザーが鳴った際にリセット操作を自動で行うかを設定する。EB装置は走行中に1分間無操作だった場合にブザーが鳴り、その際に数秒以内にリセット操作を行わないと非常ブレーキがかかり停車する。
羽衣橋駅での6両ドアカット
自動か手動かを選択。羽衣橋駅ではホームが短いため、5両以上の編成ではホームに収まらない車両のドアを締め切るドアカットを行うが、この設定項目が手動であると、ドアカットするためには「羽衣橋スイッチ」を取り扱う必要がある。
表示設定
UIなどの表示に関する設定。実質的に難易度を左右する設定項目もある。
言語設定
日本語、English（英語）、简体中文（簡体字）、繁體中文（繁体字）の4つからUIに表示される言語を選択。製作者は日本人であるため、日本語以外は正しい翻訳になっていない可能性あり。
残り距離表示
なし、m、cm、m⇔cmの4つから停止位置までの残り距離の表示の有無と表示方法を選択。m⇔cmの場合は、停止位置から±3m以内ではcm表示になり、それ以外ではm表示になる。
運転車両表示
なしかありかを選択。なしは自作の運転台風コントローラを使用する場合向けの設定で、運転乗務中の車両が表示しないことで、画面内に運転台が見えなくなる。
車両の揺れ
状況に合わせてどの程度車両が揺れるかをバーで指定する。
HP表示
なしかありかを選択。乗務中のUIにHPを表示するかを設定する。
スコア表示
なしかありかを選択。乗務中のUIにスコアを表示するかを設定する。
停止位置ガイド
なし、標識、地面、両方の4つから停止位置ガイドの表示の有無と表示方法を選択。停止位置の指定した部分が黄色に点滅して目立つようになる。
ガイドメッセージ
なしかありかを選択。ありの場合、乗務中に画面下部にすべき操作やその操作のキーアサインがガイドメッセージとして表示される。
ナビゲーション
なしかありかを選択。ありの場合、乗務中に画面左側に停止位置、速度制限までの距離をグラフで示すナビゲーションが表示される。
画面設定
3DCGの表示方法や、ゲームの画面モードなどの設定。この項目のみ、変更時は画面設定を反映するを押さなければ反映されない。
画面クオリティ
1から6までの整数を選択。数字が大きいほど3DCG表示のクオリティが上がる。
垂直同期
OFF、Full、Halfの3つからモニタのリフレッシュレートと同期するかを選択。
アンチエイリアス
OFF、FXAA、SMAA、TAAの4つからアンチエイリアス処理を行うかとその方法を選択。
画面モード
以下の3種類から画面モードを選択する。
- フルスクリーン(占有)
フルスクリーンで表示する。他のウィンドウとは同時に表示できない。負荷は最も軽い。 - ボーダーレスフル
フルスクリーンで表示する。他のウィンドウとも同時に表示でき、切り替えが容易にできるが、負荷はフルスクリーン(占有)より高め。 - ウィンドウ
ウィンドウ画面で表示する。負荷はフルスクリーン(占有)より高め。
画面解像度
以下の13種類から画面解像度を選択する。
- 1024x576
- 1280x720
- 1280x800
- 1600x900
- 1920x1080
- 1920x1200
- 2560x1080
- 2560x1440
- 3440x1440
- 3840x720
- 3840x2160
- 5760x1080
- Custom
Customは設定ファイルから指定した解像度になる。
画面設定2
主に描画クオリティなどに関する設定。
画面エフェクト
人物表示
天球の描画精度
太陽位置の変化を計算
ライティング
描画距離
カメラ移動方法
カメラ軸X
カメラ軸Y
視点変更時の位置リセット
VR
Dynamic GPU Occlusion Culling
サウンド設定
音量など、音響関連の設定。音量は全てバーで指定する。
マスター音量
ゲーム全体の音量を指定する。
BGM音量
BGMの音量を指定する。このゲームではBGMはメニューなどで流れ、乗務中には流れない。
車内放送音量
車内のスピーカーから流れる車内放送の音量を指定する。
車外放送音量
車外のスピーカーから流れる車外放送の音量を指定する。
駅放送音量
駅のスピーカーから流れる駅放送の音量を指定する。
モーター音音量
電車のモータが発する音の音量を指定する。なお、モーターが付いていない車両でモーターの音が聞こえるようにするにはモーター音の設定を変更する。
エアー音音量
空気ブレーキ使用時に電車が発するエアー音の音量を指定する。
運転士音声音量
運転乗務においてゲーム内の運転士が行う確認歓呼の音量を指定する。自分で確認歓呼をしたい場合は音量を0にするとよい。
ドア音量
電車のドアが発する動作音の音量を指定する。
ATS音量
自動列車停止装置（ATS）が発する音声の音量を指定する。
ブザー送信音量
プレイヤーが送信した車内合図ブザー（または電鈴）の音量を指定する。現実では自分で鳴らした車内合図ブザーが聞こえないようになっている車両があるため、これを再現する場合はこの音量を0にするとよい。
ブザー受信音量
受信した車内合図ブザー（または電鈴）の音量を指定する。このゲーム中にはブザーを受信したことで様々な行動をする場面があるため、この音量を0にするのはおすすめできない。
その他運転台音量
運転台の機器類の操作音などの音量を指定する。
モーター音
以下のどちらかを選択する。
- 動力車のみ
モーターが設置されている車両（動力車）に乗務している時にのみモーター音が聞こえる。 - 常時
乗務している車両にモーターが設置されていない場合にもモーター音が聞こえる。
メニューBGM
メニュー画面で流れるBGMをTRAIN CREW THEME（デフォルト）とDiagnosisのどちらか選択。Diagnosisは結果表示画面で流れるBGM。
操作設定
操作全般に関する設定。
キー割り当て
キー割り当ての画面に移動する。
WASD移動優先（運転）（車掌）
無効か有効かを選択。WASDキーが移動以外のキーと被る場合に、この設定を無効にすることにより、WASD移動する際にShiftまたは左マウスボタンを同時に押す必要があるようにすることで、キー被りを回避することができる。運転モードと車掌モードのそれぞれで別の設定にすることができ、運転モードは無効、車掌モードは有効にするのがおすすめ。
コントローラ1～3
無効か有効かを選択。TRAIN CREWが直接対応している外部コントローラを使用するかを選択する。
外部デバイス入出力
無効か有効かを選択。有効にすると、コントローラ開発用キットを用いて開発されたソフトにゲームの情報を渡すことができる。TRAIN CREWが直接対応していない外部コントローラなどを使用するため、入出力用ソフトを同時起動して使用する場合にこの項目を有効にする必要がある。
車掌用特殊入力
無効か有効かを選択。自作した車掌用コントローラを使用する場合向けの設定で、有効にするとPauseキーをドア開閉、ScrollLockキーを非常ブレーキスイッチに設定する。
鉄道設定
鉄道マニア向けの設定項目。主に一部の音源の差し替えなど。
連絡合図
車内で乗務員の連絡に用いる合図音。
連絡合図音
ブザー1～7、電鈴1～3、(Custom wav file)の10+1つから音源を選択。現実の様々な車両風の音源が用意されている。(Custom wav file)を選択した場合、外部のWAVファイルを用いて自由な音源を使用することができる。
合図音ピッチ
合図音の音の高さをバーで指定する。
出発合図方式
Default(－)、Type2(・)、Type3(・－)、Type4(・・)、Type5(None)の5つから出発合図の打数と長さを選択する。Type5の場合は、営業列車では知らせ灯式となり、出発合図は行わなくなる。回送などの非営業列車ではデフォルトと同じ合図になる。
停車予告合図
Default(・－)、Type2(・－－)、Type3(－)、Type4(・)、Type5(・・)、Noneの6つから停車予告合図の打数と長さを選択する。Noneの場合は、停車予告合図は行わなくなる。
戸閉知らせ灯
DefaultかType2を選択。両者で戸閉知らせ灯の形状と位置が異なる。
乗降促進放送
ドアを閉める前に車外スピーカーで流す必要がある放送。通勤車と特急車で別設定。
乗降促進ベル
None(Default)、Buzzer_1～2、Bell_1～6、Chime_1～3、Whistle、Melody_1～2、(Custom wav file)の15+1つから乗降促進声の前に鳴るベル、チャイム、メロディなどを選択。(Custom wav file)を選択した場合、外部のWAVファイルを用いて自由な音源を使用することができる。
乗降促進声
None、Jp1(Default)～4、En1～2、Whistle、Jp1_2～4_2、(Custom wav file)の12+1つから乗降促進ベルの後に鳴る音声を選択。(Custom wav file)を選択した場合、外部のWAVファイルを用いて自由な音源を使用することができる。
乗降促進ボタン
以下の3種類から乗降促進ボタンの操作方法を選択する。
- 短押し
乗降促進ボタンを1回押すことで乗降促進ベル、乗降促進声の順で1回流れる。 - 長押し
乗降促進ボタンを長押ししている間に乗降促進ベルが流れ続け、ボタンを離すと乗降促進声が1回流れる。 - Alternate
乗降促進ボタンを押すたびにON/OFFが切り替わる方式。ONの間に乗降促進ベルが流れ続け、OFFに切り替えると乗降促進声が1回流れる。