コヴナント戦争終結から 4 年。未知の惑星レクイエムに降り立ったコルタナとマスターチーフは、人類史上最大の敵に遭遇する。 キャンペーン モードでは、プレイヤーはマスターチーフとなって新旧の敵と戦い、10 万年におよんだ因果の真相に迫る。AI コルタナを唯一の道連れとして、故郷から遠く離れた地で、人類の生存をかけた戦いが始まる。