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添付1～8つのシナリオを選択し、オリジナルのシナリオとしてプレイできるモード。
特定の条件を満たすと、フリーモード専用の武将（他勢力）やステージも選べるようになる。
- 各年代ごとに1つずつ選択してセットできる。従来のように1つだけ選んでプレイすることもできる。
- 勝利条件による分岐はなし。選んだ順番で必ず進行する。
- 無双モード同様、セーブデータを作成して途中経過のセーブが可能。
- 新しくフリーモードを始めるたびに、馬や副将は未装備の状態で選び直しになる（装備武器だけは保持される）。
- シナリオを複数セットし、連続でステージをクリアする度に獲得武器は良質になっていく。
ステージ・勢力 
| 年代1 | |||
|---|---|---|---|
| 交趾救援戦 孫堅軍 | 交趾救援戦 南蛮軍 | 黄巾の乱 討伐軍 | 黄巾の乱 黄巾党 |
| 長坂逃亡戦 黄巾党 | 水関の戦い 連合軍 | ||
| 年代2 | |||
| 虎牢関の戦い 連合軍 | 虎牢関の戦い 董卓軍 | 界橋の戦い 公孫瓚軍 | 江陵の戦い 孫堅軍 |
| 徐州掃討戦 曹操軍 | 徐州掃討戦 陶謙軍 | ||
| 年代3 | |||
| 寿春の戦い 孫策軍 | 呉郡の戦い 孫策軍 | 宛城の戦い 曹操軍 | 宛城の戦い 張繍軍 |
| 下邳の戦い? 曹操軍 | 下邳の戦い? 董卓軍 | ||
| 年代4 | |||
| 官渡の戦い 曹操軍 | 官渡の戦い 袁紹軍 | 関羽千里行 関羽軍 | 汝南逃亡戦 劉備軍 |
| 大徳救出戦 劉備軍 | 黎陽の戦い 曹操軍 | 夏口の戦い 孫策軍 | |
| 年代5 | |||
| 長坂の戦い 曹操軍 | 長坂の戦い 劉備軍 | 赤壁の戦い 曹操軍 | 赤壁の戦い 連合軍 |
| 襄陽の戦い 劉備軍 | 荊州四郡攻略戦 孫権軍 | ||
| 年代6 | |||
| 馬家捕縛戦 曹操軍 | 潼関の戦い 曹操軍 | 益州侵攻戦 劉備軍 | 黄河の戦い 呉軍 |
| 黄河の戦い 袁紹軍 | 合肥の戦い 魏軍 | 合肥の戦い 呉軍 | 定軍山の戦い 蜀軍 |
| 年代7 | |||
| 樊城の戦い 魏軍 | 樊城の戦い 蜀軍 | 夷陵の戦い 呉軍 | 夷陵の戦い 蜀軍 |
| 南中平定戦 蜀軍 | 南中平定戦 南蛮軍 | 石亭の戦い 呉軍 | 合肥新城の戦い 魏軍 |
| 合肥新城の戦い 呉軍 | 白帝城の戦い・呉軍 | ||
| 年代8 | |||
| 五丈原の戦い 魏軍 | 五丈原の戦い 蜀軍 | 赤壁復讐戦 魏軍 | 長江決戦 呉軍 |
| 赤壁決戦 蜀軍 | 第六次北伐 蜀軍 | 長安攻城戦 蜀軍 | 建業の戦い 魏軍 |
| 許昌の戦い 呉軍 | 成都の戦い 魏軍 | ||
フリーモード専用ステージ
| シナリオ | 勢力 | 出現条件 |
|---|---|---|
| 虎牢関の戦い | 董卓軍 | 虎牢関の戦い（連合軍）のステージ達成度100% |
| 下邳の戦い? | 董卓軍 | 下邳の戦い?（曹操軍）のステージ達成度100% |
| 官渡の戦い | 袁紹軍 | 官渡の戦い（曹操軍）のステージ達成度100% |
| 黄河の戦い | 袁紹軍 | 官渡の戦い（袁紹軍）のステージ達成度100% |
| 黄巾の乱 | 黄巾党 | 黄巾の乱（討伐軍）のステージ達成度100% |
| 長坂逃亡戦 | 黄巾党 | 黄巾の乱（黄巾党）のステージ達成度100% |
| 交趾救援戦 | 南蛮軍 | 交趾救援戦（孫堅軍）のステージ達成度100% |
| 南中平定戦 | 南蛮軍 | 交趾救援戦（南蛮軍）のステージ達成度100% |
| 大徳救出戦 | 劉備軍 | 左慈をプレイヤーとして選択可能にする。 |
| 宛城の戦い | 張繍軍 | 大徳救出戦（劉備軍）のステージ達成度100% |
