Linux/BiostationViewer

Last-modified: 2008-05-27 (火) 10:05:48

BiostationViewerのインストール

Viewerのインストールパッケージの取得

省略

本体以外に必要なもの

インストール及び実行には以下のものが必要です

java SDK or JRE
java3d

これの他にViewer本体インストール時に

reducebabel

というものがインターネット経由でダウンロード、インストールされます
proxy環境下の場合は環境変数でproxyの設定が必要です

Linuxへのインストール

楽々ですよーさくっといきます

手順

  1. Javaをインストールする
  2. Java3Dをインストールする
  3. Viewerをインストールする

1.Javaのinstall

このへん
既にSUN Java以外にJavaが入っている場合は
こことかを参考にしてSUN Javaが使えるようにしておきます

2.Java3Dライブラリのインストール

ダウンロードしてきたファイルが/<downloaded>にあるとすると

chmod 775 /<downloaded>/Java3d-hoge.sh
cd /usr/java/default
sh /<downloaded>/Java3d-hoge.sh

でお終い

3.BiostationViewerのインストール

インストールはインストーラを実行すれば良いだけですがその前にreduceのダウンロードURLが更新されたらしく違っているので変更します
.tar.gzファイルを解凍してできたディレクトリ以下のインストールに関るファイル

BiostationViewer/tool/install/do_install_reduce.sh

を編集します
編集前

site_dir="php/downlode.php?filename=../ftpsite/pub/software/reduce"

編集後

site_dir="php/downlode.php?filename=/downloads/software/reduce"

あとは

cd BiostationViewer
sh install.sh

です。

4.環境

cd /usr/loca/AdvanceSoft/BioStation/bin
ln -s linux/biostationviewer.sh .

in .bashrc
csh

source /usr/local/AdvanceSoft/shell/BioStation.cfg.csh

bash

source /usr/local/AdvanceSoft/shell/BioStation.cfg.sh

以降

biostationviewer.sh

でok

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