戦艦や機動母艦といった強力なユニットのことである。 機動兵器ユニットに比べて移動などで大きく制限が掛かる反面、一つ一つのユニットが強力であり後半のステージでは艦船ユニットが主体となることが多い。
ちなみに艦船ユニットであっても、巡洋艦と駆逐艦はペルガミノに進入できるのに対し、戦艦や機動母艦は進入できずダメージを受けたユニットはそれっきりなので注意。