難易度2以降、現在出撃できる最高難易度（1つ下でもOK?）に一定回数出撃すると発生する、難易度の高いミッション。
クリアするとパーソナルアビリティシステムで使用するGAPを入手できる。
通常･高難易度任務と異なり、クリア済みのミッションであってもGAPを獲得可能。
また、基本報酬の獲得率は通常任務と同等だが、APの入手量が多めで、遺された神機もレア枠のものが出やすい。
作戦支援のカードは必ず星マークが出現する。（1人で複数出た場合、2枚目以降が◆2つになる）
特務が発生した状態で他のミッションを受注すると、特務が消滅してしまうので注意。
セーブさえすれば電源を落としても消えないので、自信がなければマルチプレイで他の人を誘うのもあり。
下線付きのアラガミが討伐対象となる。
それ以外のアラガミは例え大型であってもスキル「駆除技術」が有効。
難易度2
※STORY 09以降に発生
| ミッション名 | フィールド | ターゲット | 報酬 | 備考 |
|---|---|---|---|---|
| グリーニング | 黎明の亡都 | オウガテイルx15 コクーンメイデン×3 | 500fc等 | オウガテイルは無尽蔵に出現 |
難易度3
※STORY 24以降に発生
| ミッション名 | フィールド | ターゲット | 報酬 | 備考 |
|---|---|---|---|---|
| 雪月花 | 鎮魂の廃寺 | ウコンバサラ シユウ コンゴウ | 1600fc等 | 上から順に時間経過で出現 |
難易度4
※STORY 37以降に発生
| ミッション名 | フィールド | ターゲット | 報酬 | 備考 |
|---|---|---|---|---|
| アイアン・フィスト | 贖罪の街 | サリエル ガルム | 2250fc等 |
難易度5
※STORY 61以降に発生
| ミッション名 | フィールド | ターゲット | 報酬 | 備考 | |
|---|---|---|---|---|---|
| ライン・ダンス | フェイズ1 | 贖罪の街 | コンゴウ ヤクシャ カバラ・カバラ シユウ堕天 | 4250fc等 | カバラとシユウ堕天は時間経過で出現 |
| フェイズ2 | 蒼氷の峡谷 | ラーヴァナ ヴァジュラ | 2550fc等 | ||
難易度6
※STORY 80以降に発生
| ミッション名 | フィールド | ターゲット | 報酬 | 備考 | |
|---|---|---|---|---|---|
| グレイシャル・ウォール | フェイズ1 | 創痕の防壁 | シユウ グボロ・グボロ堕天(火) マルドゥーク | 4000fc等 | マルドゥークは時間経過で出現 |
| フェイズ2 | 鎮魂の廃寺 | サリエル堕天 ボルグ・カムラン堕天(火) | 3000fc等 | ||
難易度7
※STORY 以降に発生
| ミッション名 | フィールド | ターゲット | 報酬 | 備考 | |
|---|---|---|---|---|---|
| 戦士の鑑 | フェイズ1 | 鉄塔の森 | ハガンコンゴウ 暴走神機兵・長刀型 | 5250fc等 | |
| フェイズ2 | エイジス | 零號神機兵 ヴァジュラテイル（雷）×∞ | 3500fc等 | ||
| フェイズ3 | 鎮魂の廃寺 | クアドリガ堕天 デミウルゴス | 5250fc等 | ||
難易度8
※STORY 以降に発生
| ミッション名 | フィールド | ターゲット | 報酬 | 備考 | |
|---|---|---|---|---|---|
| 猛き心臓 | フェイズ1 | 鉄塔の森 | グボロ・グボロ堕天（火） シユウ セクメト | 8000fc等 | |
| フェイズ2 | 蒼氷の峡谷 | スサノオ キュウビ | 6000fc等 | ||
| フェイズ3 | 贖罪の街 | ボルグ・カムラン 暴走神機兵・長刀型×2 | 8000fc等 | ||
| フェイズ4 | 神機兵保管庫 | ウロヴォロス堕天 | 4000fc等 | ||
難易度9
※STORY 以降に発生
| ミッション名 | フィールド | ターゲット | 報酬 | 備考 | |
|---|---|---|---|---|---|
| 無線中継所メンテナンス | フェイズ1 | 愚者の空母 | グボロ・グボロ堕天（火）×2 ウコンバサラ | 9000fc等 | |
| フェイズ2 | エイジス | スサノオ ヴァジュラ | 6750fc等 | ||
| フェイズ3 | 嘆きの平原 | コンゴウ ヤクシャ・ラージャ 暴走神機兵・長刀型 | 9000fc等 | ||
| フェイズ4 | 贖罪の街 | ディアウス・ピター セクメト×2 | 4500fc等 | ||
難易度10
※STORY 以降に発生
| ミッション名 | フィールド | ターゲット | 報酬 | 備考 | |
|---|---|---|---|---|---|
| リベリオン | フェイズ1 | 鎮魂の廃寺 | ハガンコンゴウ グボロ・グボロ×2 | 12000fc等 | |
| フェイズ2 | 贖罪の街 | シユウ堕天×2 ヤクシャ・ラージャ×2 | 15000fc等 | ||
| フェイズ3 | 鉄塔の森 | オウガテイル×3 コンゴウ ハガンコンゴウ シユウ セクメト | 15000fc等 | ||
| フェイズ4 | 蒼氷の峡谷 | プリティヴィ・マータ スパルタカス グボロ・グボロ堕天（氷）×4 | 9000fc等 | ||
難易度11
※STORY 以降に発生
| ミッション名 | フィールド | ターゲット | 報酬 | 備考 | |
|---|---|---|---|---|---|
| アルソミトラ | フェイズ1 | 黎明の亡都 | セクメト×2 ウコンバサラ×2 | 20000fc等 | |
| フェイズ2 | 鉄塔の森 | クアドリガ堕天×2 オウガテイル堕天6 | 12000fc等 | ||
| フェイズ3 | エイジス | グボロ・グボロ堕天（火）×4 ニュクス・アルヴァ | 20000fc等 | ||
難易度12
※STORY 以降に発生
| ミッション名 | フィールド | ターゲット | 報酬 | 備考 | |
|---|---|---|---|---|---|
| ウィーラー・ディーラー | フェイズ1 | 愚者の空母 | コクーンメイデン堕天（氷）×3 コンゴウ堕天×2 グボロ・グボロ堕天（氷）×3 | 30000fc等 | |
| フェイズ2 | 贖罪の街 | ヴァジュラ×2 ディアウス・ピター | 24000fc等 | ||
| フェイズ3 | 鉄塔の森 | ハガンコンゴウ セクメト ヤクシャ・ラージャ×2 | 30000fc等 | ||
難易度13
※STORY 以降に発生
| ミッション名 | フィールド | ターゲット | 報酬 | 備考 | |
|---|---|---|---|---|---|
| 二の矢 | フェイズ1 | 終末の神林・幹部 | ヴァジュラテイル（火）×2 クアドリガ コクーンメイデン堕天（火）×3 | 16000fc等 | |
| フェイズ2 | 終末の神林・末梢端部 | セクメト ガルム | 24000fc等 | ||
| フェイズ3 | 終末の神林・主根部 | グボロ・グボロ堕天（火） シユウ ハンニバル グボロ・グボロ堕天（火） シユウ | 32000fc等 | ||
| フェイズ4 | 終末の神林・階層核 | ハガンコンゴウ ヤクシャ ウコンバサラ | 32000fc等 | ||
| フェイズ5 | 終末の神林・末梢基部 | コンゴウ堕天×2 マグナガウェイン | 32000fc等 | ||
難易度14
※STORY 以降に発生
| ミッション名 | フィールド | ターゲット | 報酬 | 備考 | |
|---|---|---|---|---|---|
| 残月 | フェイズ1 | 変容の神門・主根部 | ヤクシャ ヤクシャ・ラージャ2 | 56000fc等 | |
| フェイズ2 | 変容の神門・階層核 | ザイゴート堕天（雷）×3 サリエル サリエル堕天 | 42000fc等 | ||
| フェイズ3 | 変容の神門・上幹部 | ウコンバサラ ツクヨミ | 42000fc等 | ||
| フェイズ4 | 変容の神門・根端部 | シユウ堕天×2 セクメト | 56000fc等 | ||
| フェイズ5 | 変容の神門・基底部 | ヤクシャ・ティーヴラ×2 オントバサラ×2 | 70000fc等 | ||
難易度15
※STORY 以降に発生
| ミッション名 | フィールド | ターゲット | 報酬 | 備考 | |
|---|---|---|---|---|---|
| パジェムカ | フェイズ1 | 淘汰の神梯・基底部 | ラーヴァナx2 シユウx2 ザイゴート堕天(炎)x3 | 100000fc 等 | |
| フェイズ2 | 淘汰の神梯・側幹部 | スパルタカス グボロ・グボロ堕天(氷)x2 | 80000fc 等 | ||
| フェイズ3 | 淘汰の神梯・中幹部 | 暴走神機兵・長刀型 コクーンメイデン堕天(氷)x5 | 60000fc 等 | ||
| フェイズ4 | 淘汰の神梯・終端部 | マルドゥーク セクメトx2 | 80000fc 等 | ||
| ファラオ | フェイズ1 | 淘汰の神梯・辺縁部 | テスカトリポカ コンゴウx2 | 80000fc 等 | |
| フェイズ2 | 淘汰の神梯・側幹部 | カリギュラ シルキーx3 | 40000fc 等 | ||
| フェイズ3 | 淘汰の神梯・側端部 | グボロ・グボロx2 ウコンバサラx2 | 100000fc 等 | ||
| フェイズ4 | 淘汰の神梯・側根部 | ハガンコンゴウx2 金色のヴァジュラ | 60000fc 等 | ||
| 深層の怪物 | フェイズ1 | 終末の神林・末梢幹部 | セクメトx2 グボロ・グボロ堕天(炎)x2 ニュクス・アルヴァ×2 | 100000fc 等 | |
| フェイズ2 | 終末の神林・末梢端部 | シユウ堕天x2 コンゴウ堕天x2 ヴァジュラテイル(雷)x3 | 100000fc 等 | ||
| フェイズ3 | 萌芽の神域・樹林4層 | シユウ グボロ・グボロx2 | 80000fc 等 | ||
| フェイズ4 | 萌芽の神域・洞穴3層 | ムクロキュウビ ヤクシャ・ラージャx2 | 80000fc 等 | ||
| グランド・チェンバレン | フェイズ1 | 変容の神門・階層核 | 白鉄の神機兵・長刀型x3 | 80000fc 等 | 非バースト中：防御力↓大 |
| フェイズ2 | 淘汰の神梯・側根部 | キュウビ ハガンコンゴウ コンゴウ | 80000fc 等 | ||
| フェイズ3 | 萌芽の神域・樹林3層 | ラーヴァナ ヤクシャ・ラージャ ヤクシャ | 80000fc 等 | ||
| フェイズ4 | 萌芽の神域・鎮魂の座 | ハンニバル神速種 | 40000fc 等 | ||
| エル・マーゴ | フェイズ1 | 萌芽の神域・脈動の座 | ヤクシャ・ラージャx3 ハガンコンゴウx3 | 140000fc 等 | 非バースト中：防御力↓中 |
| フェイズ2 | 萌芽の神域・洞穴1層 | ディアウス・ピター ラセツコンゴウx2 | 80000fc 等 | ||
| フェイズ3 | 萌芽の神域・洞穴？層 | クロムガウェイン ボルグ・カムラン | 60000fc 等 | 0～3分：アラガミ視覚↑中,聴覚↑中 | |
| フェイズ4 | 萌芽の神域・山岳1層 | エインヘリアル | 40000fc 等 | ||
| 菊花 | フェイズ1 | 淘汰の神梯・辺縁部 | デミウルゴス カリギュラ グボロ・グボロ堕天(氷)x2 コンゴウ堕天x2 | 140000fc 等 | 0～2分：防御力↓中 |
| フェイズ2 | 変容の神門・主根部 | マグナガウェイン 暴走神機兵・長刀型x2 白鉄の神機兵・長刀型x2 | 80000fc 等 | ||
| フェイズ3 | 萌芽の神域・樹林2層 | セクメト グボロ・グボロ堕天(氷) ハガンコンゴウ オントバサラ | 100000fc 等 | ||
| フェイズ4 | 萌芽の神域・蒼天の座 | ルフス・カリギュラ | 40000fc 等 | ||
| アヴァロンの林檎 | フェイズ1 | 終末の神林・末梢基部 | ハンニバル侵喰種 ハンニバル オントバサラx3 | 120000fc 等 | |
| フェイズ2 | 変容の神門・基底部 | カリギュラ・ゼノ | 40000fc 等 | ||
| フェイズ3 | 淘汰の神梯・側根部 | クアドリガ堕天 プリティヴィ・マータ コンゴウ堕天x2 | 100000fc 等 | ||
| フェイズ4 | 萌芽の神域・山岳3層 | マガツキュウビ キュウビ 暴走神機兵・長刀型 | 100000fc 等 | ||
テンプレート
単発ミッション
| ミッション名 | フィールド | ターゲット | 報酬 | 備考 | |
|---|---|---|---|---|---|
| ミッション名 | フィールド名 | 討伐対象アラガミ 非討伐対象アラガミ | fc 等 | ||
サバイバルミッション
| ミッション名 | フィールド | ターゲット | 報酬 | 備考 | |
|---|---|---|---|---|---|
| ミッション名 | フェイズ1 | フィールド名 | 討伐対象アラガミ 非討伐対象アラガミ | fc 等 | |
| フェイズ2 | フィールド名 | 討伐対象アラガミ 非討伐対象アラガミ | fc 等 | ||