ファイナルファンタジーと他作品のコラボレーション
リンクの墓
エルフの町の墓を調べると「リンクここにねむる」とゼルダの伝説ネタが表示される。
思いっきり他社作品だがゼルダのほうも同様に他社作品のロトの墓が存在する。
飛空挺のシド
Ⅱ以降でおなじみになった飛空挺技師のシドだがゲームボーイアドバンス版からは初代ファイナルファンタジーにも逆輸入されルフェイン人のシドが飛空挺を作ったという事にされた。
ファイナルファンタジー３～６のボス
ゲームボーイアドバンス版からの追加ダンジョン「ソウルオブカオス」では続編シリーズのボスが登場。
PSP版では音楽も元の登場作品に合わせたアレンジが用意された。
名前
ゲームボーイアドバンス版のリメイクからはキャラクターネーム作成時にセレクトを押すと続編シリーズに登場したサブキャラクターの名前がランダムで選ばれるようになった。
プレリュード＆オープニングテーマ
本作の導入曲である２曲は続編で繰り返しアレンジされて使われシリーズの代表曲になっている。
戦闘シーンのイントロ
戦闘音楽のイントロに刻まれるベースラインはシリーズのお約束ネタとして６作目まで一貫して使われ７以降も部分的に現れる事がある。
クラーケン
カオスのうちクラーケンだけなぜかファイナルファンタジー３で水のクリスタルの守護者という同じポジションで再登場している。
４匹のカオス
原点回帰を謳ったファイナルファンタジー９で揃って再登場。ガーランドも重要キャラの一人として登場している。
グルグ火山
ファイナルファンタジー９で同じ名前のダンジョンがあり音楽も同曲のアレンジ。
ディシディアファイナルファンタジー
ファイナルファンタジーから光の戦士（ウォーリアオブライト）とガーランドが参戦