Magicカスタマイズ
1周回ごとに各GRADEごとの1つを選択取得可能。
3周回ですべての要素が揃うことになり、4周回目以降は全要素が初期から適用され、後述のドグマコマンドも最初から解放される。
GRADE-1
SPアライズ
毎ターン味方フェイズ開始時に回復するSPの量が、5から8に上昇する
リペアアライズ
毎ターン味方フェイズ開始時、HPとENが最大値の10％回復する。HP、EN回復系の特殊能力を持つ場合、+される形になる。
フォースアライズ
毎ターン味方フェイズ開始時、全味方パイロットの気力が+2される。
GRADE-2
コストゲイン
マップクリア時に、そのマップで味方が敵に与えた総ダメージの1/20を資金として獲得する。
TacPゲイン
マップクリア時に、そのマップで撃墜した敵機体数×10のTacポイントを獲得する。
ダブルゲイン
マップクリア時に、そのマップで味方が敵に与えた総ダメージの1/40の資金と、敵機体数×5のTacポイントを獲得する。
GRADE-3
ここでは「ダメサポ」か「コスサポ」の事実上の2択。
もともと消費SPが低い「感応」「先見」は効果が薄い。
ダメージサポート
精神コマンド「熱血」「魂」の消費SPが85％になる。
ターゲットサポート
精神コマンド「感応」「先見」の消費SPが80％になる。
コストサポート
精神コマンド「幸運」「祝福」の消費SPが75％になる。
GRADE-4
フォースブースト
ExCが3まで上昇したパイロットの気力上昇上限が+10される。ExCが下がってもマップクリアまで効果は継続。
レンジブースト
ExCが3まで上昇した機体のマップ兵器及び射程1以外の武器の最大射程が+1される。ExCが下がってもマップクリアまで効果は継続。
アクセルブースト
ExCが3まで上昇した機体の移動力が+1される。ExCが下がってもマップクリアまで効果は継続。
GRADE-5
インファイトアップ
「格闘」属性の武器の攻撃力が+200される。
ガンファイトアップ
「射撃」属性の武器の攻撃力が+200される。
オールラウンドアップ
「格闘」「射撃」属性の武器の攻撃力が+100される。
GRADE-6
SPプラス
マップ出撃時に全味方パイロットのSPが+20される。
ExCプラス
マップ出撃時に全味方パイロットのエクストラカウントが+1される。
フォースプラス
マップ出撃時に全味方パイロットの気力が+10される。
ドグマコマンド
各GRADEのカスタマイズで主人公機のドグマコマンドが増える。
行動終了後も選択可能。
ルート周回ではインターミッション後にいきなりGRADE6で始めることも出来る。
（ので、本来撤退に追い込むのがやっとのシャアを撃破するのも楽。）
意力のSPRITA
解放条件はGRADE1の選択解放。
周囲3マス以内の味方ユニット1機（自機を含む）のメインパイロットのSPを25回復する。
源泉のPOTANT
解放条件はGRADE2の選択解放。
周囲2マス以内にいる味方ユニット（自機を含む）全てのENが50回復する。
戦陣のAUXLUM
解放条件はGRADE3の選択解放。
隣接する味方ユニットのExCが1上昇する。
力場のPALAS
解放条件はGRADE4の選択解放。
周囲2マス以内にいる敵ユニット全てにEN-100、「運動性▼」「装甲値▼」「照準値▼」を付与する。
跳躍のSALIRA
解放条件はGRADE5の選択解放。
周囲4マス以内にいる味方ユニット1機を4マス以内の任意位置（選択したユニットが移動できない位置は除く）に移動させる。
魂魄のPRODIG
解放条件はGRADE6の選択解放。
周囲3マス以内にいる味方ユニット1機に（自機を含む）に「魂」「気迫」「ダイレクトアタック」「スマッシュヒット（効果は一戦闘のみ）」を掛ける。