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添付- 機体改造
- 登場機体
- オリジナル
- 無敵鋼人ダイターン3
- 聖戦士ダンバイン
- 機動戦士ガンダムF91および機動戦士クロスボーン･ガンダム 鋼鉄の7人
- ガンダム Gのレコンギスタ
- 機動戦士Zガンダム、機動戦士ZZガンダム
- 機動戦士ガンダム 逆襲のシャア、小説版 逆襲のシャア ベルトーチカチルドレン
- 魔神英雄伝ワタル
- バディ・コンプレックス
- クロスアンジュ 天使と竜の輪舞
- 天元突破グレンラガン
- 新機動戦記ガンダムW ～Endless Waltz～
- 勇者特急マイトガイン
- コードギアス 反逆のルルーシュR2
- 真マジンガー衝撃!Z編、真マジンガーZEROvs暗黒大将軍
- ふしぎの海のナディア
- 魔装機神 THE LORD OF ELEMENTAL
機体改造 
改造費用
| 費用 | 50% | 130000 |
|---|---|---|
| 100% | 470000 | |
| 150% | 720000 | |
| RANK5 | 120000 | |
| RANK10 | 465000 | |
| RANK15 | 915000 |
フル改造ボーナス
カスタムボーナスに関しては各機体毎に異なる。
フル改造ボーナスに関しては全機体共通。
15段階まで解放されていても10段階で獲得可能。（15段階強化してもボーナスはナシ）
下記のうちいずれか1つを獲得可能。
※『超銀河グレンラガン』、『天元突破グレンラガン』はグレンラガンと超銀河ダイグレンの強化パーツを合わせた形になるため、強化パーツスロット増枠は選択不可。
- 地形適応 空・陸・海・宇のうちを1つを一段階上げる。
- 移動力+1
- 武器射程+1
- バリア・アーマー消費ENを半減
- 強化パーツスロット1枠増。
登場機体
オリジナル
無敵鋼人ダイターン3
聖戦士ダンバイン
- ダンバイン
- ビルバイン
- ウイング･キャリバー
- サーバイン?
- ビアレス
機動戦士ガンダムF91および機動戦士クロスボーン･ガンダム 鋼鉄の7人
備考
XBガンダムと共に合流するトビアはシーブック、セシリーの未来の姿であるキンケドゥ、ベラ艦長を隠しており、記憶喪失を詐称している。
ガンダム Gのレコンギスタ
- G-セルフ（大気圏パック）
- G-セルフ（宇宙用パック）?
- G-セルフ (パーフェクトパック）?
- G-アルケイン フルドレス
- メガファウナ
- G-ルシファー?
- モラン?
- ダハック?
- トリニティ?
備考
G-セルフは分岐シナリオで「宇宙」を選択した場合、宇宙用パックが換装可能になる。地上ルート選択時は合流シナリオ以降で換装可能。
機動戦士Zガンダム、機動戦士ZZガンダム
- Zガンダム?
- ウェイブ･ライダー?
- 百式?
- ガンダムMk-Ⅱ?
- ZZガンダム
- Gフォートレス?
- キュベレイMk-Ⅱ 紫?
- メタス?
- メタス（MA）?
- ザクⅢ改?
- フルアーマーZZガンダム
- キュベレイMk-Ⅱ 赤?
- クィン・マンサ?
備考
第29話「薔薇のバーサーカー」にて洗脳されたマシュマーにファが襲われた際にカミーユが心神耗弱状態から復帰し、ルーと交替してZガンダムパイロットとして合流。その際に武装も追加される。また、洗脳が解けたマシュマーとザクⅢ改、ファとメタスも合流する。
機動戦士ガンダム 逆襲のシャア、小説版 逆襲のシャア ベルトーチカチルドレン
備考
機体登場作品は本作だが、リ･ガズィ（BWS）はルー（ZZ）のジェガンはケルベス(Gレコ)の機体として味方に合流する。
第20話後の分岐で「宇宙」を選択するとヤクトドーガ2機を入手。
第35話内のイベントでアムロがクンパからHi-νを、同ステージで条件を満たすとシークレットシナリオにてシャアがナイチンゲールを入手する。（詳細は隠し要素参照）
魔神英雄伝ワタル
備考
「空神丸」はゲスト機。パイロットのクラマと共に一度も出撃可能メンバーになることなく撃墜され、その後は「龍王丸」変身時に自動的に合体する。
第29話分岐ルートでドアクダーを選択した場合、第30話「正義と友情と」のイベントにて戦神丸、幻神丸は撃墜されるが「空王丸」で参戦するクラマと共に「戦王丸」「幻王丸」で復活参戦する。
第42話でワタルとの一騎討ち後に虎王と邪虎丸が加わる。
バディ・コンプレックス
クロスアンジュ 天使と竜の輪舞
- ヴィルキス
- レイザー
- アーキバス･サリア･カスタム?
- グレイブ･ヒルダ･カスタム?
- グレイブ･ロザリー･カスタム?
- ハウザー エルシャ･カスタム?
- ハウザー クリス･カスタム?
- アーキバス･バネッサ･カスタム?
- 焔龍號
- アーキバス･ヒルダ･カスタム?
- クレオパトラ?
- レイジア?
- テオドーラ?
備考
サリア以下5名のカスタム機は分岐シナリオ「再会のアルゼナル」で合流する。（第17話で別ルートでも合流）
タスクのバネッサ・カスタムは第19話「決別」で合流。
サラマンディーネ等と焔龍號は分岐シナリオ「極寒の死闘」で合流する。（第23話で別ルートでも合流）
分岐シナリオ第32話「過去からの亡霊」でサリア、エルシャ、クリスが離反。（第34話で別ルートでも反映）
第36話「決戦ミスルギ皇国」でジルのレイジアが加入し、サリア、エルシャ、クリスも復帰。サリア機がクレオパトラにヒルダ機がテオドーラになる。
天元突破グレンラガン
- グレンラガン
- 超銀河ダイグレン?
- 超銀河グレンラガン?
- スペースガンマール ギミー機
- スペースガンマール ダリー機
- スペースキングキタン
- スペースヨーコWタンク
備考
ヴィラルは当初は敵。第11話からグレンラガンのサブパイに。
第40話からヨーコたち4人が参戦。（各機体改造度は3）
第49話からダイグレンが参戦し、イベントで合体して超銀河グレンラガンとなる。
武装もさることながら精神コマンドが5人分かつEXオーダーも使用可能という超弩級スーパーロボット。
第50話でのイベントでキタンが死亡。スペースキングキタンの改造費用とキタンに使用したTacPが返還される。
第51話よりニアもサブパイに加わり、最終形態の天元突破グレンラガンとなる。
新機動戦記ガンダムW ～Endless Waltz～
備考
五飛のアルトロンのみ当初は敵として登場し、撃墜後に自動的に味方に加わる。（マナの国ルート第15話）
同話にてゼクス、ノイン、ヒイロ。16話で残る3人が初期配置から味方となる。
勇者特急マイトガイン
備考
ブラックマイトガインは前作では隠し機体。本作では分岐シナリオ内にて味方機となる。
第29話分岐ルートで「ドアクダー」を選んだ場合、第30話「正義と友情と」でマイトガインが復活参戦し、マイトカイザーとの合体でグレートマイトガインとなる。
コードギアス 反逆のルルーシュR2
備考
スザク、カレンは17話味方増援として加わる。
アーニャのモルドレッドとジェレミアのサザーランドは当初は敵側機体として登場。（第17話「眠る魔王」）
その後、ルルーシュがゼロに復帰したタイミング（第18話「目覚める決意」）で待ち構えていたように寝返って味方機に、また同じタイミングでC.C.が登場し、ランスロット・Fと蜃気楼が合流する。
真マジンガー衝撃!Z編、真マジンガーZEROvs暗黒大将軍
備考
第28話「闇と光」のイベントにて甲児がマジンカイザーに、鉄也がマジンエンペラーGに自動的に乗り換える。
ただし、マジンガーZとグレートマジンガーは喪われたわけでなくその後は乗り換え可能。
最終分岐で「強敵がいるかも知れない」（ホープスルート）を選び、第51話でイベント出現するマジンガーZEROとの最終決戦を制すると撃破後から最終話までの間、甲児がマジンガーZEROを扱える。（条件は隠し要素参照）
