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添付既存曲と構成やテンポが同じものを”リテイク”、構成やテンポが異なるものや主題のみが使われているものなどを”アレンジ”と便宜上呼称する。
「蒼穹のファフナー THE BEYOND」オリジナルサウンドトラック vol.1 
| 曲目 | 初出回 | 備考 |
| 01.序章-蒼穹作戦- | 第1話 PV 第7話 帰らぬ人となりて | |
| 02.未来を求める者 | 「ナイトヘーレ開門/反撃」アレンジ・アップテンポ | |
| 03.単騎決戦 | ||
| 04.窮地 | 第3話 運命の器 | 「序章―はじまり―」リテイク |
| 05.別離 | 第3話 運命の器 | 「真実」アレンジ |
| 06.隠された真実 | 第4話 力なき者 | 「異変」リテイク |
| 07.暴走 | 第4話 力なき者 | |
| 08.正体 | 第2話 楽園の子 | 「脱出」アレンジ |
| 09.悲憤 | 第8話 遺されしを伝え | 「哀しみの蒼穹」アレンジ |
| 10.マリスの正義 | 第3話 PV 第1話 蒼穹作戦 | |
| 11.先の見えない世界 | 第2話 楽園の子 | 「序章―新たな戦い―/犠牲の果て」リテイク |
| 12.願い | 第2話 PV |
「蒼穹のファフナー THE BEYOND」オリジナルサウンドトラック vol.2
| 曲目 | 初出回 | 備考 |
| 01.進撃 | 第9話 第二次L計画 | 「ファフナー -誓い-/対話の道、そして帰る場所」リテイク |
| 02.献身 | 「蒼穹のファフナー」リテイク | |
| 03.未来を求める者(take 2) | 第9話 第二次L計画 | 「ナイトヘーレ開門/反撃」アレンジ・スローテンポ |
| 04.統制 | 4-6話 PV 第4話 力なき者 | ほとんどの使用シーンでは長尺になっている |
| 05.正体(take 2) | take 2とあるが全く別の曲 | |
| 06.マークアレス | 第7話 帰らぬ人となりて | |
| 07.浄化 | ||
| 08.未来への一歩 | 10-12話第2弾 PV | |
| 09.再生 | ||
| 10.再生(take 2) | ||
| 11.故郷 | ||
| 12.おかえり、ただいま | 「蒼穹のファフナー -フィナーレ-」リテイク |
未収録曲
| 曲目 | 初出回 | 備考 |
| 01.未収録曲1 | 第2話 楽園の子 | 「偽りの楽園」のリコーダー独奏 |
| 02.未収録曲2 | 第6話 その傍らに | EXODUSから使われている「修羅」のアレンジ 本作では主旋律にチャイムが追加されている |
