「蒼穹のファフナー EXODUS」オリジナルサウンドトラック vol.1
| 曲目 | 初出回 | 備考 |
| 01.序章 | 本編未使用 第2クール放送時期発表PV | PVで使われたものは冒頭にギターが追加されている |
| 02.ORIHIME | 第01話 来訪者 | 完全長尺版のみ |
| 03.2つの希望 | 第02話 希望の名は | |
| 04.平穏 | 第14話 夜明けの行進 | |
| 05.悪寒 | 第05話 新世界へ | |
| 06.楔 | 第04話 継承者たち | |
| 07.誇り | 第01話 来訪者 | ショパン作曲「木枯らし」のアレンジ |
| 08.運命 | 本編未使用 ドラマCD「The Follower」 | |
| 09.契機 | 第06話 祝福のとき | |
| 10.硝煙 | 第02話 希望の名は | |
| 11.火中 | 第06話 祝福のとき | |
| 12.変態 | 第08話 平和を夢見て | |
| 13.疑心 | 本編未使用 | |
| 14.焦燥 | 第08話 平和を夢見て | |
| 15.休息 | WEBラジオ 第1回 TBE第5話 教え子 | |
| 16.世界樹アショーカ | 第04話 継承者たち | |
| 17.次世代 | 本編未使用 | |
| 18.圧倒的絶望 | 第03話 対話の代償 | |
| 19.激闘 | 第12話 戦場の子供たち | |
| 20.無慈悲 | 第17話 永訣の火 | |
| 21.死命 | 第05話 新世界へ |
「蒼穹のファフナー EXODUS」オリジナルサウンドトラック vol.2
| 曲目 | 初出回 | 備考 |
| 01.EXODUS | 第08話 平和を夢見て | |
| 02.水面下 | 第02話 希望の名は | |
| 03.交差 | 本編未使用 ドラマCD「The Follower」 | |
| 04.浸食 | 第06話 祝福のとき | |
| 05.不可侵 | 第20話 戦士の帰還 | |
| 06.逆上 | 第07話 新次元戦闘 | |
| 07.戦慄 | 第02話 希望の名は | |
| 08.禁忌 | 第07話 新次元戦闘 | 7話では冒頭が収録版より長い |
| 09.転生 | 第08話 平和を夢見て | |
| 10.最終兵器 | 第13話 闇の中の未来 | |
| 11.死闘 | 第10話 希望の地へ | |
| 12.人類が求めたもの | 第20話 戦士の帰還 | 既存曲(HAE「激闘」)のアレンジ |
| 13.修羅 | 第21話 目覚めの時 | 21話では冒頭のコーラスがインストに変更されている |
| 14.虚無 | 第07話 新次元戦闘 | |
| 15.犠牲の果て | 本編未使用 | 既存曲(HAE「序章－新たな戦い－」)のアレンジ |
| 16.絆 | 本編未使用 | |
| 17.残された希望 | 第10話 希望の地へ |
未収録曲
| 曲目 | 初出回 | 備考 |
| 01.未収録曲1 | 第19話 生者の誓い | 「修羅」のメロディが使われている |
| 02.未収録曲2 | 第22話 憎しみの記憶 | 未収録曲1の冒頭に「修羅」のコーラスを追加。25話でも使用 |
| 03.Separation(オルゴール) | 第22話 憎しみの記憶 | 無印から使われているが未収録 |
| 04.PV使用曲1 | 第1弾PV | |
| 05.PV使用曲2 | 第2弾PV | |
| 06.PV使用曲3 | 第3弾PV |