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添付公開形態 
完全長尺版が第2話と共に2014年12月27日から2015年1月11日まで先行上映され、放映版は完全長尺版よりシーンがカットされたものとなっている。放映版は主にAパートのハワイ戦、Bパートの「楽園」でのシーン等がカットされている。
OP
本編とテロップが重なっており、今回は流れず。
BGM
モーガン隊出撃時に流れていたのはフレデリック・ショパンの「練習曲作品25第11番（別名：木枯らし）」を原曲とした「07.誇り」で、オリジナルサウンドトラックvol.1に収録されている。
完全長尺版ではロブがコクピット内でラジカセの再生ボタンを押すシーンがある。
保健室のTVに映し出されていた広登の番組「歌陽ショー」
無印第10話にも『スペシャルスター歌揺曲ショー』として広登が出演したものがある他、無印第19話の盆祭りのお知らせにも『スペシャル歌「陽」ショー』なる催事が掲載されている。
咲良「あの子見てると、昔の一騎を思い出すわ」 剣司「昔の……な」
身体能力の高さを指していると思われる。
広登の制作番組
- 歌謡番組：「愛♪」で切れているのは無印第10話のセルフオマージュと思われる。
- 機動侍ゴウバイン（実写？）
- 「堂馬広登スペシャル 謎の巨大生物を追え！」：クワガタの着ぐるみを着用しているのは言うまでもなく芹。
卒業証書
西尾家に飾られていたもの。「本学園高等部の全課程を卒業したことを証する」と書かれている。
暉が第三二七号、里奈が第三二八号となっており、卒業年月日はどちらも「二一呉一年三月二十日」。
なお、竜宮島学園の学園長は史彦が務めている模様。
第1話は2151年6月28日のため、2人が19歳であることがわかる。
西尾商店
彗が買ったガム「ミヤカワ オレンジ フーセンガム」は、実在する商品「マルカワ オレンジ フーセンガム」がモチーフと思われる。
容子「ここではクルー兼教官よ」
初出は『HEAVEN AND EARTH』でのワンシーン。
暉「作った人の名前つけるの、ここのルールですよね。一騎カレーとか」 一騎「溝口さんが勝手につけたんだよ」
『HEAVEN AND EARTH』参照。暉カレーに対する総士の感想のくだりは放映版ではカットされている。
飛行教練
用語については「竜宮島回覧板EXODUS第6号」
を参照。
メロンフロート
たかがメロンフロート、されどメロンフロート。炭酸のツブツブ表現等のためにＡ木氏はCGに着手した。とかありますEXODUS
ニーベルング接続による小規模な同化現象
ニーベルング・システムに指を通す事によって、指の付け根に生じる痕。
元は小説版の設定（同化現象によるものかは不明）で、アニメではこれまで言及されていなかった。
第1話時点で指輪の痕が見られるのは、一騎、剣司、カノン、芹、暉、ナレイン、ダスティン。
堂馬食堂
無印第1話の敵襲来時でも同様のシーンが存在する。
ED
OP同様、今回はなし。本作ではキャストのテロップが脚本・作画監督の後に表示されている。
スタッフロールの後、サブタイトルが表示されている。
BGM
羽原信義＠ワルシャワ野…Alvis @NobuyoshiHabara
『蒼穹のファフナー』は斉藤恒芳さん作曲、ワルシャワフィルハーモニーオーケストラによる壮大かつ繊細な音楽が特徴ですが、実はその楽曲を生かす「選曲」もこれまたスゴいんです！
羽原信義＠ワルシャワ野…Alvis @NobuyoshiHabara
第一話は劇場公開された「全長版」と、オンエア尺に合わせた「TVオンエア版」の二種類があるのですが、そのTV版のラストでかかるBGM「ナイトヘーレ開門（M10）」が編集されていたのにお気付きの方も多いのではないでしょうか。
羽原信義＠ワルシャワ野…Alvis @NobuyoshiHabara
最初のティンパニが響く「デン、デン、デン…」のイントロ部分が繰り返し繋いであって、広登のセリフが終わってホワイトアウトする瞬間にヴァイオリンが入り、さらにカメラがCDCに入る瞬間にトランペットという、もう画面にシンクロしてテンションが上がるしかない編集が施されています。
羽原信義＠ワルシャワ野…Alvis @NobuyoshiHabara
これは音響監督の三間さんの手によるものです。細かな編集をする事で、キャラクターの心情や戦闘のアクションをさらに盛り上げてくれています。そしてこの編集がもうすさまじいスピードで行われ、みるみる画面にピッタリ合っていく様子は、後ろで見ていて血がたぎってきます。まさしくプロの技！
次回予告
タイトル、話数、サブタイトルのみで映像はなし。予告ナレーションもシンプルなものになっている。
スタッフコメント
羽原信義（監督／第1話絵コンテ・演出*1も担当）
羽原信義＠ワルシャワ野…Alvis @NobuyoshiHabara
第１話をご覧になって頂いた皆様、ありがとうございます！どうぞ最後までお付き合いくださいませ。
能戸隆（総監督）
あっという間に終わったー。第１話ご視聴ありがとうございました。第２話までしばしお待ちください。２話は上映版とちょっと違います。なんかコツコツとギリギリまでやってます(笑)
三間雅文（音響監督）
『蒼穹のファフナーEXODUS』には、二つの第1話が存在するんだよね〜。どっちも良いけど、やはりロングバージョンを観て貰いたいと思ってしまう…。
写真、間違えたw。もうすでに数話まで、作業が進んでいるのでw。これが、TV版とロング版の台本。当然、作業は2回行ったわけで…。
