東崎倉市（とうざきそういち）
声 - 中村悠一
日本の国防大臣である男性。
強い正義感を秘めた人当たりの良い人物。国と国民を愛し、善政を尽くしているため多くの国民達から支援されている。
異を唱える者も容赦なく抹殺するニンジャボーグの生業に反感を抱き、彼に狙われるのを覚悟の上でニンジャボーグ達を国際指名手配に仕立て上げた。
ジェニファー・キャトレット
声 - 日笠陽子
アメリカの女性軍人。狙撃手でアメリカでも一番の実力者でもある。
かなりの寡黙で必要以上に言葉を口にする事が少ない。
大統領の命令でニンジャボーグの暗殺の為に日本に来た。
ジョージ・カールトン
声 - 武内駿輔
アメリカ大統領。
無差別殺人を繰り返すニンジャボーグに危機感を覚え、自身もニンジャボーグに狙われるのを覚悟の上でジェニファーに暗殺命令を下す。
神山北斗（かみやまほくと）
声 - 神奈延年
毒のスペシャリストである暗殺者の男性。
かつて兄がニンジャボーグに異を唱えた為に抹殺されたのを目撃している。
その後、ニンジャボーグへの憎しみから独学で暗殺術を覚え、現在の様な暗殺者となった。
ニンジャボーグへの復讐を目論んでいる。
アンゼルム・デアフリンガー
声 - 山野井仁
ドイツの軍人である男性。階級は大佐。
数々の修羅場を潜り抜けたスペシャリストで白兵戦を得意とし、「白兵の鬼」と呼ばれている。教官としても優れており、厳しい訓練で兵士達を鍛えている。
好戦的な性格をしているが強い愛国心を秘め、国の国防と平和の為に励んでいる。
ドイツの大統領の命令でニンジャボーグ達の排除の為に部隊を引き入れて日本に来た。
モデルは『こちら葛飾区亀有公園前派出所』の爆竜鬼虎、『ストリートファイター』のロレント。
フリードリヒ・ウェンドランド
声 - 上田燿司
ドイツ大統領。
アンゼルム同様愛国主義者で、これ以上の犠牲者を出す前に自身もニンジャボーグに狙われるのを覚悟の上でアンゼルムに暗殺命令を下す。
望月天音（もちづきあまね）
声 - 若山詩音
現代に生きるくノ一の少女。
クールな性格だが、必要以上に相手を傷つけることを嫌う優しさの持ち主。
くノ一としても優秀で、与えられた任務はスマートに達成する。
祖父からの任務でニンジャボーグ達と対立する。
ニンジャボーグ達と対立する中でその内の一人であるホーネットボーグを討ち取る事に成功した。
ちなみにナデシコボーグとは助けてくれた恩があり、協力関係になる。
號雷院盛吉（ごうらいいんもりよし）
声 - 櫻井トオル
日本政府に公認されている暗殺の剣士。
常に鎧を纏い、仮面を付けてその素顔は不明。「號雷院流」という二刀流の使い手。
自由と平等を愛する人物であり、例え殺しの対象でなければ殺さないなど無用な殺生を嫌う。
ニンジャボーグ達を「史上最悪の悪鬼」と見なしており、殲滅を目指している。
その凄まじい実力でガンボーグの両腕を切り落としてから首を斬って討ち取った。この際にガンボーグに遺言を言わせるなど多少の慈悲を与えていた。
その後はアサシンボーグと戦い、彼の右腕と左脚を斬り落とした。
天音に憎しみをぶつけるビーストボーグに「それか貴様らがこの時代の人達に与えた悲しみだ。被害者面するな！」と一喝したり、ニンジャボーグに「こんなクソみたいな時代でも結局はお前達の未来に繋がる。なら何故この様な蛮行が必要なのだ？」と言うなど心理戦や話術も優れている。
黒沢影次（くろさわえいじ）
声 - 河本啓佑
戦国時代から続く忍衆「牙影」の現当主。天音とは友人関係。
常に冷静沈着で如何なる状況でも決して揺るがない精神力と人間離れの身体能力を持っている。
先代当主の父の命令で部下達とニンジャボーグ達の暗殺を目指す。
