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添付番号はサウンドトラックのトラックナンバーより。
FINAL FANTASY IX Original Soundtrack 
| No. | 名前 | 備考 |
| 1-1 | いつか帰るところ | タイトル画面 |
| 1-2 | 嵐に消された記憶 | ガーネットの回想ムービー |
| 1-3 | 作戦会議 | 劇場艇での作戦会議 |
| 1-4 | アレクサンドリアの空 | 劇場艇のアレクサンドリア到着時ムービー |
| 1-5 | ビビのテーマ | アレクサンドリア（ビビ操作時） |
| 1-6 | この刃に懸けて | 劇（戦闘イベント） |
| 1-7 | Vamo' Alla Flamenco | 劇（チャンバラ）、ここほれ！チョコボ |
| 1-8 | 決行～姫をさがして～ | アレクサンドリア城（ガーネット探索時） |
| 1-9 | 月なきみそらの道化師たち | ゾーンとソーン関連イベント |
| 1-10 | スタイナーのテーマ | スタイナー関連イベント |
| 1-11 | プリマビスタ楽団 | プリマビスタ楽団演奏 |
| 1-12 | 奪われた瞳 | ガーネットが誘拐をジタンに頼み込む |
| 1-13 | 今宵 | 劇中BGM |
| 1-14 | あなたのぬくもり | 劇中BGM |
| 1-15 | あやまちの愛 | 劇中BGM |
| 1-16 | 深淵の女王 | ブラネ関連イベント |
| 1-17 | ざわめく森 | 魔の森・ピナックルロックス |
| 1-18 | バトル1 | 通常戦闘 |
| 1-19 | ファンファーレ | 戦闘勝利時 |
| 1-20 | あの日の記憶 | ガーネット関連イベント |
| 1-21 | バトル2 | ボス戦闘 |
| 1-22 | ゲームオーバー | 戦闘全滅時 |
| 1-23 | 走れ！ | 魔の森等の脱出イベント |
| 1-24 | おやすみ | 宿屋宿泊時 |
| 1-25 | あの丘を越えて | フィールド画面（Disc1～3） |
| 1-26 | 氷の洞窟 | 氷の洞窟 |
| 1-27 | 辺境の村 ダリ | ダリ |
| 1-28 | 黄昏の彼方に | ダリ（地下）、リンドブルム市街地（Disc2） |
| 1-29 | 盲進スタイナー | ダリでのスタイナーのイベント |
| 1-30 | 限りある時間(とき) | ダリでのビビのイベント |
| 1-31 | ジタンのテーマ | ダリからの飛空艇搭乗時 |
| 1-32 | 黒のワルツ | 黒のワルツ関連のイベント |
| 2-1 | シドのテーマ | リンドブルム城 |
| 2-2 | 一難去って… | フライヤと出会った時 |
| 2-3 | リンドブルム | リンドブルム市街地 |
| 2-4 | 記憶の歌 | リンドブルムでのガーネットの歌 |
| 2-5 | ハンターチャンス | 狩猟祭、ハーデス戦 |
| 2-6 | ク族の沼 | ク族の沼 |
| 2-7 | クイナのテーマ | カエルとり |
| 2-8 | アロハ・de・チョコボ | チョコボの森 |
| 2-9 | ウクレ・le・チョコボ | チョコ搭乗時 |
| 2-10 | フライヤのテーマ | ギザマルークの洞窟 |
| 2-11 | 国境の南ゲート | 国境の南ゲート |
| 2-12 | フェアリーバトル | 精霊モンスター戦 |
| 2-13 | ブルメシア王国 | ブルメシア |
| 2-14 | 忘れられぬ面影 | フライヤの回想シーン |
| 2-15 | クジャのテーマ | クジャ関連のイベント |
| 2-16 | 迷いの剣 | ベアトリクス戦 |
| 2-17 | 眠らない街 トレノ | トレノ |
| 2-18 | タンタラスのテーマ | バクーのおしおき |
| 2-19 | 背徳の旋律 | クジャ関連のイベント |
| 2-20 | ガーネットのテーマ | トット先生の回想 |
| 2-21 | 古根の道 ガルガン・ルー | ガルガン・ルー、フォッシル・ルー（ガルガント登場後） |
| 2-22 | クレイラの幹 | クレイラの樹 |
| 2-23 | クレイラの街 | クレイラの街 |
| 2-24 | 永遠の豊穣 Eternal Harvest | フライヤが踊るイベント |
| 2-25 | 空を愁いて | フライヤが踊った後に流れるBGMなど |
| 2-26 | 抽出 | 召喚獣抽出 |
| 3-1 | 襲撃 | クレイラ襲撃、ガーネット救出時 |
| 3-2 | ローズ・オブ・メイ | ベアトリクス関連のイベント |
| 3-3 | フォッシル・ルー | フォッシル・ルー（ガルガント登場前のみ） |
| 3-4 | 山吹く里 コンデヤ・パタ | コンデヤ・パタ |
| 3-5 | 黒魔導士の村 | 黒魔道士の村 |
| 3-6 | とどかぬ想い | アレクサンドリア（襲撃後） |
| 3-7 | 神前の儀 | コンデヤ・パタ「神前の儀」 |
| 3-8 | エーコのテーマ | エーコ関連のイベント |
| 3-9 | 廃墟 マダイン・サリ | マダイン・サリ |
| 3-10 | 召喚壁 | 召喚壁 |
| 3-11 | イーファの樹 | イーファの樹 |
| 3-12 | サラマンダーのテーマ | サラマンダー関連のイベント |
| 3-13 | 欲望の足音 | クジャ関連のイベント |
| 3-14 | おれたちゃ盗賊 | タンタラス関連のイベント |
| 3-15 | ラブレター大作戦 | エーコのラブレターイベント |
| 3-16 | クアッド・ミスト | クアッドミスト |
| 3-17 | モーグリのテーマ | モグネット本部 |
| 3-18 | 守るべきもの | アレクサンドリア（スタイナーとベアトリクスが共に戦う） |
| 3-19 | 召喚されし者 | アレクサンダー召喚時 |
| 3-20 | 時の管理者 | ガーランド関連のイベント |
| 3-21 | ウイユヴェール | ウイユヴェール |
| 3-22 | 刻まれた過去 | ウイユヴェール語り部の間 |
| 3-23 | 振りカエルと奴がいる | デザートエンプレス（シド操作時） |
| 3-24 | 聖なる地 エスト・ガザ | エスト・ガザ |
| 3-25 | グルグ火山 | グルグ火山 |
| 3-26 | とけた魔法と心 | シドとヒルダガルデ・ファブール再会時 |
| 4-1 | 飛空艇 ヒルダガルデ | 飛空艇ヒルダガルデ |
| 4-2 | 隠者の書庫 ダゲレオ | ダゲレオ |
| 4-3 | イプセンの古城 | イプセンの古城 |
| 4-4 | 4枚の鏡 | 「4枚の鏡」について話す時 |
| 4-5 | それぞれの戦い | 地脈の祠 |
| 4-6 | テラ | テラ |
| 4-7 | 魂無き村 ブラン・バル | ブラン・バル |
| 4-8 | 時を刻む城 パンデモニウム | パンデモニウム |
| 4-9 | 独りじゃない | パンデモニウムのジタンのイベント |
| 4-10 | 消えぬ悲しみ | 黒魔道士の村のイベント |
| 4-11 | 悪霧ふたたび | フィールド画面（Disc4） |
| 4-12 | 銀竜戦 | 記憶の場所突入時 |
| 4-13 | 記憶の場所 | 記憶の場所 |
| 4-14 | クリスタルワールド | クリスタルワールド |
| 4-15 | 破滅への使者 | トランス・クジャ戦 |
| 4-16 | 最後の闘い | ラスボス戦 |
| 4-17 | 甘く悲しい恋 | 劇中BGM |
| 4-18 | 裏切りの口づけ | 劇中BGM |
| 4-19 | 君の小鳥になりたい | 劇中BGM |
| 4-20 | 盗めぬ二人のこころ | 劇中BGM |
| 4-21 | その扉の向こうに | エンディングムービー |
| 4-22 | Melodies Of Life～Final Fantasy | エンディング |
| 4-23 | プレリュード | 「THE END」画面 |
| 4-24 | CCJC TVCM 15" | コカ・コーラのCM（15秒バージョン） |
| 4-25 | CCJC TVCM 30" | コカ・コーラのCM（30秒バージョン） |
| 4-26 | Melodies Of Life ［The Layers Of Harmony］ | 「Melodies Of Life」の英語版 |
FINAL FANTASY IX Original Soundtrack PLUS
メインのサントラに入りきれなかったBGMを補完したサウンドトラック。
主にイベントシーンやムービーで流れるBGMが集められているが、その分、1曲自体は短め。
本作では、ムービーで流れるBGMは全て生演奏による楽曲が使われている。その為こちらのCDの収録曲は、後半のおまけトラックを除いて全て生オケである。
| No. | 名前 | 備考 |
| 1 | ブラネ登場～劇開幕 | 劇が開幕する時のムービー |
| 2 | 万国旗スタイナー激突 | スタイナーがプリマビスタに落ちる時のムービー |
| 3 | アレクサンドリアからの脱出 | 劇場艇アレクサンドリア脱出 |
| 4 | プリマビスタ墜落 | 劇場艇が魔の森に墜落するムービー |
| 5 | ブランク石化 | ブランクが石化するムービー |
| 6 | 黒魔道士vs黒魔道士 | 飛空艇から黒魔道士達が落下するムービー |
| 7 | 南ゲート突破 | 飛空艇が南ゲートを突破するムービー |
| 8 | リンドブルム王国到着 | 飛空艇がリンドブルムに到着するムービー |
| 9 | 歌～ジタンとダガー | リンドブルムでガーネットが歌っている所にジタンが来た時のムービー |
| 10 | ブルメシアから去るクジャ | ブルメシアからクジャが去る時のムービー |
| 11 | 召喚獣発動クレイラ消滅 | クレイラがオーディンによって破壊されるムービー |
| 12 | リンドブルム炎上 | リンドブルムが襲撃される時のムービー |
| 13 | リンドブルム壊滅 | リンドブルムが襲撃される時のムービー |
| 14 | 霧の消滅 | 霧が消滅するムービー |
| 15 | ダガー回想（召喚士村の滅亡） | ガーネットの回想シーンムービー |
| 16 | 召喚！バハムート | ブラネがバハムートを召喚するムービー |
| 17 | 全滅ブラネ艦隊 | ブラネの艦隊が壊滅するムービー |
| 18 | 新女王誕生 | ガーネットが女王に即位した時のムービー |
| 19 | バハムート来襲 | アレクサンドリアがバハムートに襲撃された時のムービー |
| 20 | エーコ降下 | 飛行艇からエーコが飛び降りる時のムービー |
| 21 | アレクサンダー召喚 | アレクサンダー召喚ムービー |
| 22 | 幽霊船 | インビンシブル登場時のムービー |
| 23 | ダガー救出 | ジタンがダガーを救出するムービー |
| 24 | 髪を切るダガー | 「今までのわたしを覚えていてね……」 |
| 25 | ダガー回想（幽霊船） | ガーネットの回想シーンムービー |
| 26 | ネオクジャ崩壊 | クジャがテラを破壊する時のムービー |
| 27 | テラより脱出 | テラより脱出する時のムービー |
| 28 | ジタン、ダガー別れ | ジタンがクジャの元へ向かう際に飛空艇を見送るムービー |
| 29 | クジャの元へ | ジタンがクジャの元へ向かう時のムービー |
| 30 | ルーファウス歓迎式典 Millennium Version | 魔の森でプリマビスタ楽団が演奏するBGM（FF7の「ルーファウス歓迎式典」のアレンジ） |
| 31 | ドーガとウネ | 黒魔道士の村の宿屋にある蓄音機のBGM（FF3の「ドーガとウネの館」のアレンジ） |
| 32 | マダイン・サリの娘 | アレクサンドリア（エーコ操作時） |
| 33 | クジャのテーマ Millennium Version | デザートエンプレス |
| 34 | Main | 「Melodies Of Life」のアレンジ |
| 35 | Waltz | 「深淵の女王」のアレンジ |
| 36 | Kogaku Motet1 | 「いつか帰るところ」のアレンジ |
| 37 | Organum | 「刻まれた過去」のアレンジ |
| 38 | Mediteiranean | 「いつか帰るところ」のアレンジ |
| 39 | Dokokade3 | 未収録曲 |
| 40 | Weuber | 未収録曲 |
| 41 | Kuja5 | 「クジャのテーマ」のアレンジ |
| 42 | Melodies Of Life (Silent Mix) | 「Melodies Of Life」の英語版アレンジ |
