アールエスのストーリーシナリオは、新しいダンジョンを制覇するごとに1話進行します。
- シナリオの進行とは関係のないダンジョンが存在しますが、これらは非常にRankが高かったり、現れたり消えたりするランダムダンジョンなので容易に判別できます。
- サブシナリオのほとんどはメインの進行とは関係がありませんが、一部はシナリオ進行に必須です。
- ボス戦以外、ゲーム中で発生する何度かのイベントバトルには勝利しなくてもシナリオは進行しますが、勝利できればレアアイテムが手に入ります。(取り返しの付かないこと参照)
- シナリオの進行でパーティーを抜ける仲間もいますが、最終的には全員使用可能になります。(→仲間加入・離脱一覧)
目次
地球編 (第0~11話) 
- ダンジョンの出現条件を確認しながら現れたダンジョンを攻略しましょう。
シナリオは通常このように、新たなダンジョンを出現させクリアすることにより進行します。
攻略するダンジョンに決まった順番はありませんが、Rankの低いものから順に攻略していくのが無難です。 - 9話に到達し、未制覇のダンジョンに入れなくなったら、中央島の<塔>へ行ってください。
月編 (第12~15話)? 
- 一本道なので詰まる心配はありません。
地球塔編 (第16~24話)? 
- 20話に到達するまで、未制覇のダンジョンを攻略していきましょう。
20話に到達できない場合は出現条件を満たすことが出来るにもかかわらず、出現させていないダンジョンがあります。
(古マーザン森、魔鳥の岩壁、精霊寺院跡が未出現である可能性が高いです。) - 20話に達したら秘美研究所の文明5以上で合成に出現する地球塔昇降機を作成してください。
塔4000階を制覇後、まだ見ていない場合は黒平原を2度制覇してタンホイザーに会うサブシナリオを見ましょう。
それからもう一度、塔4000階を制覇すると2度目のタンホイザーイベントが発生します。
更にもう一度、塔4000階を制覇すると3度目のタンホイザーイベントが発生し、地球塔臨時階段が建築できるようになります。 - 地球塔臨時階段を建築後は塔6666階を制覇し、また再度、塔6665階を制覇してください。
冥界編 (第25~34話)? 
- ハデスの口までは一本道なので詰まる心配はありません。
途中のイベントバトルは負けてもシナリオは進行しますが、勝利できればレアアイテムが手に入ります。 - ハデスの口を制覇後、冥土の底、ハデスの腹、魂人の廃都を順にもう一巡りしてカベイリアに会うサブシナリオを見ると、冥界王朝宮が出現します。
- ルインドアースへ到着後は塔地下二百階の門へ向かいます。
その後は占星術士の館を2度制覇し、再び冥界王朝宮へ、塔地下二百階の門をもう一度抜けてください。