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添付BbSと同じく「デッキコマンド」が導入されている。
「アタックコマンド」や「マジックコマンド」と同じく、「フィニッシュコマンド」も続投しているが、今作では「オーバークロック」の設定によって発動できるようになるまでにためるゲージの量が異なり、発動するクロックレベルの設定が高いほど多くのクロックゲージをためる必要があるが、フィニッシュコマンドの威力も高くなる。
「オーバーレイコマンド」はボスステージ専用の強力なコマンドで、対応するコマンドアイテムを入手すると使えるようになるが、使用回数に制限がある。
オリンポスコロシアム内のバトルでは通常攻撃のコンボ中、まれに「スペシャル攻撃」が出ることがある。また、デッキコマンドは「コンパイル」で普段と違う技に変化し、COMのように、コマンドを3つまでストックしてコンパイルすることもできる。
ホロウバスティオンではいつもの様にドナルドとグーフィーとパーティーを組んで戦うことになるが、データ・ソラのアタックコマンドはグーフィーの技に、マジックコマンドはドナルドの魔法に変化する。また、クロックゲージをためるとフィニッシュコマンドの代わりに連携技が発動できるようになる。
基本技 
通常時
- 基本技
- 地上振り下ろし
- 地上突き
- 地上上昇振り上げ
- 地上横回転振り
- 地上突進左振り
- 空中振り下ろし
- 空中振り上げ
- 空中横回転振り
- 空中縦回転振り
クロックアビリティ「インパクトアーツ」発動時
- 地上突進振り下ろし
- 地上突進振り上げ
- 地上上昇振り上げ
- 地上ジャンプ振り下ろし
- 地上突進左右振り
- 空中突進振り上げ
- 空中突進右払い
- 空中縦回転振り下ろし
クロックアビリティ「ソニックアーツ」発動時
- 地上上下振り
- 地上左右振り
- 地上突進突き
- 地上きりもみ上昇振り
- 地上突進右払い
- 空中上下振り
- 空中左右振り
- 空中突進突き
- 空中左右振り＆突き
- 空中縦連続回転振り
アタックコマンド
- ライズアッパー
- エリアルブレイク
- ファイアブレード
- ブリザドブレード
- サンダーブレード
- エアロブレード
- スライドダッシュ
- ヒートダッシュ
- アイスダッシュ
- スパークダッシュ
- ウインドダッシュ
- リボルブブレイク
- ファイアブラスト
- ブリザドブラスト
- サンダーブラスト
- エアロブラスト
- スライドラッシュ
- ファイアバスター
- ブリザドバスター
- サンダーバスター
- エアロバスター
- エリアルスラム
- ファイアスラム
- ブリザドスラム
- サンダースラム
- エアロスラム
- ランドクラッシュ
- ヒートダイヴ
- アイスダイヴ
- スパークダイヴ
- ウインドダイヴ
- ストライクレイド
- ファイアレイド
- ブリザドレイド
- サンダーレイド
- エアロレイド
- エリアルスイープ
- ヒートスイープ
- アイススイープ
- スパークスイープ
- ウインドスイープ
- エアスパイラル
- ヒートストーム
- アイスストーム
- スパークストーム
- ウインドストーム
- チェーンレイヴ
- ラッシュアッパー
- ハードストライク
- スタンインパクト
- イラプション
- ザンテツケン
- ジャッジオブ3
- ショックフォール
- グラビデドロップ
マジックコマンド
- ファイア
- ファイラ
- ファイガ
- トリプルファイガ
- バーストファイガ
- トリプルバースト
- フレイムフォール
- ブリザド
- ブリザラ
- ブリザガ
- トリプルブリザガ
- パスートブリザガ
- トリプルパスート
- アイシクルマイン
- サンダー
- サンダラ
- サンダガ
- チェイスサンダー
- チェイスパルサー
- スパークショック
- エアロ
- エアロラ
- エアロガ
- チェイストルネド
- チェイスウインド
- サイクロン
- ケアル
- ケアルラ
- ケアルガ
- エスナ
- マグネ
- マグネラ
- マグネガ
- スナイプマグネ
- スロウ
- ストップ
- コンフュ
- クエイク
フィニッシュコマンド
シンプルタイプ
コマンド入力タイプ
D魔法タイプ
オーバーレイコマンド
横スクロールアクション
3Dシューティング
スペシャル攻撃
コンパイル
アタックコマンド
- ソニックブリッツ?（Lv1～Lv5）
- ソニックライン?（Lv1～Lv5）
- ホーリーブレード（Lv1～Lv5）
- ホーリースター?（Lv1～Lv5）
- スラッシュライン（Lv1～Lv5）
- エクスターミネイト（Lv1～Lv5）
マジックコマンド
- エクスプロージョン（Lv1～Lv5）
- コールドライン（Lv1～Lv5）
- ゼウススピア（Lv1～Lv5）
- ゼウスブレス（Lv1～Lv5）
- フレンドケアル（Lv1～Lv3）
- ランダムライセンス（Lv1～Lv3）
イベントバトル専用技
ホロウバスティオン前編パーティー
ドナルド
グーフィー
敵が使う技
【クラウド】
【ハデス】
【ピート】
【データ・リク】
【????（データ・ロクサス）】
