アルバコア改

太平洋艦隊に編入されたアルバコアは、1942年8月12日に真珠湾へ入港する。初の任務としてトラック諸島方面の哨戒任務に就いた。9月5日にはタラワを偵察し、続いてナウルも偵察する。
偵察中の13日、トラック近海で輸送船を雷撃し損傷させた。10月1日と同月10日にも輸送船を雷撃しているが、どちらも外れた(ちなみに日本側には該当する船の記録が無い)。
クェゼリンへの偵察任務を終え、10月20日にミッドウェー島へ帰投。オエリコン20mm対空機銃1基を新たに装備した。こうしてアルバコア初の哨戒任務は終わった。
11月11日、再び出撃してソロモン方面の哨戒任務に就く。同月24日、輸送船に雷撃を行うが外れる。明後日には敵駆逐艦4隻に追い回され、爆雷攻撃を受けて損傷。気密室とケーブルの周囲に破孔が幾つか発見される。
12月13日、発見した駆逐艦3隻へ魚雷3本を撃ち込んだが、命中せず。今まで撃沈の戦果に恵まれなかったアルバコアであったが、遂に戦果を挙げる時がやってきた。
12月18日、マダンの攻略部隊を乗せた船団をビスマルク海で捕捉。距離3200ｍの地点から魚雷3本を放ち、2本が軽巡天龍に命中し撃沈した。WW2において、米潜水艦が初めて戦果を挙げた瞬間であった。
護衛の駆逐艦涼風と磯波から爆雷攻撃を受け、日本側は大破させたと認識したが実際は無傷であった。翌日、戦果確認のため現場に戻ると、木片と85個のドラム缶の破片が浮いていた。
11日後、ブリスベーンへ帰投し船体の修理を受けた。

1943年からはブリスベーンを拠点として、ビスマルク海方面での哨戒任務に就く。この海域はソロモン方面への重要な航路で、日本軍の船舶が往来しているこの海域は絶好の狩り場と成り得た。

1月20日、ビスマルク海にて通商破壊を始める。26日に輸送船を、28日に敵潜水艦を雷撃したが、命中せず。2月7日、ウェワクを偵察した。
2月20日、マヌス島北方でラバウルからウェワクへ向かう日本船団を発見。直ちに雷撃を仕掛け、護衛の駆逐艦大潮を損傷させる。この大潮は翌日、曳航に失敗して沈没した。
またアルバコアは貨物船一隻を損傷させたと記録したが、日本側に該当する船は無い。3月11日、ブリスベーンに戻る。
4月6日、再びビスマルク海を哨戒。何度か輸送船に雷撃を行ったが、戦果はからっきしであった。同月29日に船団を発見し、攻撃しようとしたものの病院船の吉野丸がいたため中止。この哨戒では戦果は無かった。
6月16日、未だ獲物が多いビスマルク海へ進出。この哨戒でも輸送船団に対し2回雷撃を行ったが、命中弾は無し。7月31日、ブリスベーンに帰投し、潜水母艦フルトンから整備を受けた。
8月23日に狩場のビスマルク海へ戻った。9月4日、ポナペで発見した輸送船団に対し魚雷4本を発射し、特設砲艦平壌丸を撃沈。久々の戦果だった。さらなる戦果を挙げるべく船団を追跡。
さらに3本の魚雷を放ったが、命中しなかった。翌日、特設運送船北昭丸を雷撃し、命中させるが不発に終わる。6日、輸送船団を雷撃。
10月12日、ブリスベーンを出港。輸送船2隻に魚雷6本を発射したが、いずれも命中せず。11月6日、僚艦スティールヘッドが発見した船団を攻撃するため向かっていたが、
その道中の8日、アメリカ第5航空軍のB-25爆撃機から誤爆を受けて小破させられてしまう。さらに10日には二度目の誤爆を受け、慌てて急速潜航をする。
18m潜ったところで、わずか135mの場所で爆発が起きる。このダメージで補助電源が全て停止。更にメインの吸気弁が損傷するが、現場にて応急修理。
それでも哨戒を続け、12日に航行不能になった軽巡阿賀野を発見。かの艦を沈めるべく忍び寄ったが、日本艦が9隻も護衛についており、駆逐艦から4時間に及ぶ爆雷攻撃を受けて退避させられた。
窮地を脱したアルバコアは25日、ロレンゴウ北西約270キロの地点で船団を発見。雷撃を仕掛けて陸軍輸送船乾山丸を撃沈した。
12月26日、ビスマルク海に舞い戻り、ツラギへ寄港した。

1944年1月12日、トラックの南西約600キロで特設運送船第二号長江丸と、それを曳航していた隼艇1隻をまとめて葬った。14日にはパラオ東方で駆逐艦漣に4本の魚雷を放ち、2本が命中。漣は轟沈した。
直後に僚艦の曙から59発の爆雷攻撃を受けるも、簡単にいなしてツラギへ戻った。その後、ミッドウェーを経由して2月22日に真珠湾へ帰投。ヴァレーホ工廠で整備を受けたのち、姉妹艦のシャドと訓練。
5月13日、真珠湾を出港。陸軍のマリアナ諸島攻略と連動して、マリアナ近海に進出。6月11日、輸送船団を発見するが攻撃は出来なかった。
そして一大決戦たるマリアナ沖海戦が生起。6月19日午前7時16分、陸上攻撃機が接近してきたため潜航してやり過ごす。一方、日本の補給部隊を追跡していた僚艦カヴァラは、各艦にその位置を通報。
カヴァラから最も近い位置にいたアルバコアは見張りを厳重にして索敵。午前7時50分、遂に本丸の日本艦隊を確認した。小沢司令官座乗の旗艦大鳳では、敵をアウトレンジで攻撃できるとして油断が生じていた。
さっそく雷撃しようと追跡を開始するが、なかなか望ましい位置に付く事が出来ない。仕方なく、やや遠距離からの雷撃を決意する。
午前8時10分、ヤップ島東方で大型空母大鳳に向けて魚雷6本を発射。うち2本が命中コースだったが、大鳳から発艦した彗星が海中に突っ込んで自ら盾となり、1本が食い止められる。
しかし残りの1本はそのまま伸びていき、ようかく気付いた大鳳側が面舵一杯で必死に回避しようとしたが命中。命中当初は平然と浮かんでいたが、艦内で不幸の連鎖が起こり、16時28分に沈没した。
アルバコアが撃沈を把握したのは翌7月15日だった。超大物を仕留めたものの、喜ぶ暇は無かった。すぐに護衛の駆逐艦「秋月」「初月」が追撃に現れ、25発の爆雷が投射された。
巧妙な攻撃に苦戦するも、どうにか離脱に成功した。

マリアナ沖海戦が米軍の勝利に終わった後の6月30日、ファイス島のリン酸塩生産施設を砲撃。7月3日には機帆船大栄丸を砲撃により撃沈。生存者を救助しようとしたが、殆どが拒否。結局5名しか救えなかった。
同月15日、メジュロに凱旋して潜水母艦ブッシュネルから改装を受けた。
8月8日、日本近海で哨戒。21日、対潜哨戒中の特設駆潜艇新港丸に魚雷3本を撃ち込んだが、回避される。9月5日、室戸岬の南方約95キロで貨物船新月丸を撃沈。6日には潮岬沖で特設掃海艇第三江口丸を撃沈した。
11日、第165号駆潜艇を撃沈。日本近海で大いに暴れまわったアルバコアは一度真珠湾へ戻った。そして1944年10月28日の通信を最後に消息不明となる。

11月7日、津軽海峡東口で哨戒任務中、第七福栄丸と遭遇する。アルバコアは海中に身を潜め、撃沈の機会を狙っていた。ところが第七福栄丸を追跡しているうちに日本軍が敷設した機雷群に突入してしまう。
その結果、触雷して沈没。艦長以下36名が死亡した。沈没してから5分の間は気泡が止まらず、また遺留品が海面に浮かび上がってきた。
第七福栄丸の乗員は漂っている物品を回収。背部に「ALB-5」と書かれた防寒ジャンパー、靴下、「ASK」と書かれた衣、ラッキーストライク一箱、キャメル五個、洗濯石鹸などがあったという。

こうして帝國海軍の心胆を寒からしめた悪魔は、最期を迎えたのだった。1945年3月30日、除籍。
沈没にまでに軍艦5隻(3万6500トン)、商船4隻(1万841トン)を撃沈した。